More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3228 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 273 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  39.55 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  41.54 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  37.79 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  36.94 
 
 		 251 aa  178  1e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  37.98 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  41.11 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  40.8 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  36.78 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  39.7 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  39.1 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  39.47 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  36.02 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  39.11 
 
 		 245 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  37.69 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  39.2 
 
 		 231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  39.84 
 
 		 233 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  36.33 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  38.19 
 
 		 237 aa  161  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  38.26 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  35.52 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36.6 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  35.77 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  33.08 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  34.94 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  35.69 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  35.88 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  39.2 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  38.34 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  35.18 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  32.48 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  38.4 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  35.85 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  31.82 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  38.68 
 
 		 247 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  35.52 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  36.74 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  37.21 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  35.88 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  37.65 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  39.41 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.2 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  35.25 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  37.89 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  37.39 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  35.88 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  35.88 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  37.8 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  35.88 
 
 		 256 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  35.61 
 
 		 258 aa  139  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  32.69 
 
 		 242 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  33.86 
 
 		 237 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  31 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  33.86 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  36.26 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  34.3 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 244 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  33.86 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  38.25 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  35.46 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  37.24 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  32.62 
 
 		 256 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  38.34 
 
 		 245 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  39.3 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  35.06 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  34.35 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  31.46 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  35.1 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  35.69 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  34.26 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1515  Silent information regulator protein Sir2  34.05 
 
 		 282 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0609928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  34.76 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  36.19 
 
 		 258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  36.09 
 
 		 266 aa  132  9e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  32.57 
 
 		 262 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  33.46 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  33.86 
 
 		 236 aa  130  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  31.08 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  31.84 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  32.03 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  38.53 
 
 		 250 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  30.38 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  30.36 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  31.5 
 
 		 245 aa  127  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  34.92 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 262 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  31.8 
 
 		 246 aa  126  5e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  31.75 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  30.19 
 
 		 243 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  31.75 
 
 		 241 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  33.73 
 
 		 243 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  35 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  30.8 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  33.98 
 
 		 244 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  35.74 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  30.35 
 
 		 238 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  31.35 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>