More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1597 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 244 aa  486  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  58.23 
 
 		 233 aa  256  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  58.16 
 
 		 241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  53.25 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  53.09 
 
 		 243 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  52.67 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  53.68 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  51.72 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  52.12 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  53.31 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  47.74 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  52.36 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.06 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  53.25 
 
 		 251 aa  210  1e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  52.89 
 
 		 244 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  51.09 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  48.92 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  48.07 
 
 		 244 aa  205  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  49.78 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  47.66 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  46.75 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  47.41 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  49.78 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  49.78 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  51.52 
 
 		 260 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  46.69 
 
 		 264 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  50.22 
 
 		 284 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 		 245 aa  201  6e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  49.13 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  43.37 
 
 		 249 aa  201  8e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  48.46 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  51.98 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  44.58 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  49.16 
 
 		 250 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  51.54 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  48.03 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  46.03 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  49.36 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  47.81 
 
 		 265 aa  191  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  41.03 
 
 		 242 aa  191  1e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  46.03 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  49.34 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  44.26 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  45.7 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  43.9 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  44.87 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  48.12 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  48.91 
 
 		 236 aa  182  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  39.57 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  40.25 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  42.99 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  45.57 
 
 		 237 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  39.83 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  40.83 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  41.6 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  43.81 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  44.21 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  43.38 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  41.44 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  44.89 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  42.31 
 
 		 243 aa  158  9e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  41.04 
 
 		 279 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  40.95 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  41.04 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  41.7 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  41.78 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  41.48 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  40.67 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  43.53 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  39.77 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  45.78 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  37.89 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  41.74 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  40.59 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  34.87 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  40.45 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  40.97 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  40.43 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  40.97 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  40.97 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  39.16 
 
 		 276 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  40.87 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  42.31 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  36.91 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  39.36 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  38.29 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  45.23 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  41.28 
 
 		 254 aa  149  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  40.76 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  34.96 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  44.3 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  39.57 
 
 		 237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  42.06 
 
 		 232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  39.75 
 
 		 263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>