More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_49820 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  100 
 
 		 250 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  86 
 
 		 250 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  54.32 
 
 		 252 aa  262  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  58.8 
 
 		 258 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  58 
 
 		 255 aa  248  8e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  53.31 
 
 		 262 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  52.65 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  51.63 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  49.37 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  53.5 
 
 		 251 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.15 
 
 		 306 aa  232  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  51.22 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  51.87 
 
 		 269 aa  227  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  51 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  53.53 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  53.36 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  53.11 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  51.67 
 
 		 246 aa  224  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  53.45 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  51.87 
 
 		 249 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 237 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  45.78 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  53.12 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  51.23 
 
 		 244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  49.32 
 
 		 230 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  53.14 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  46.15 
 
 		 266 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  52.85 
 
 		 247 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  52.48 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  45.12 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 		 241 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  47.11 
 
 		 251 aa  209  5e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  47.44 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  47.44 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  47.44 
 
 		 237 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  46.53 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  49.79 
 
 		 236 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  40.98 
 
 		 242 aa  197  9e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  48.12 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  52.07 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  50.41 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  47.64 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  41.94 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  45.31 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  42.26 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  45.83 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  46.22 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  52.07 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  41.74 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  50.94 
 
 		 260 aa  179  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  42.56 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  41.39 
 
 		 244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  46.44 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  44.59 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  45.76 
 
 		 237 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  41.1 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  44.54 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  42.21 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  41.86 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  44.54 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  39.33 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  40.95 
 
 		 235 aa  159  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  39.83 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  40.57 
 
 		 237 aa  158  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  42.56 
 
 		 232 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  36.78 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  40.52 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  40.57 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  40.25 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  40.16 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  44.63 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  41.13 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  41.31 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  39.34 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  41.06 
 
 		 239 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  40.16 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  40.33 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  39.59 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  40.33 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  40.33 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  40.33 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  40.33 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  40.33 
 
 		 279 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  40.33 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  43.48 
 
 		 230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  40.33 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  39.18 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  38.78 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  39.18 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>