More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2245 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 259 aa  521  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  65.85 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  66.25 
 
 		 266 aa  322  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  63.64 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  59.41 
 
 		 253 aa  289  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  58.33 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  57.58 
 
 		 242 aa  278  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  57.45 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  51.69 
 
 		 254 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  46.98 
 
 		 231 aa  196  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  44.22 
 
 		 253 aa  194  9e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  38.4 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  42.8 
 
 		 264 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  39.43 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  44.17 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  46.98 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  44.92 
 
 		 257 aa  188  8e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  43.62 
 
 		 253 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  40.98 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  42.39 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 		 251 aa  182  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  41.56 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  44.67 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  42.62 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  42.62 
 
 		 245 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  44.22 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  42.68 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  40.83 
 
 		 253 aa  175  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  42.45 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  40.44 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  40.44 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  39.51 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  40.52 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  36.84 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  39.92 
 
 		 252 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  36.99 
 
 		 243 aa  162  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  43.85 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  41.5 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  38.93 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  38.15 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  41.06 
 
 		 242 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  36.59 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  37.97 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  36.99 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  36.94 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  34.49 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  40.89 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  45 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  44.44 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  35.44 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  39.92 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  35.92 
 
 		 246 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  37.08 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  38.02 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  37.6 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  36.91 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  37.14 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 262 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  35.85 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  38.16 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  41.39 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  37.1 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  42.2 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  42.92 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  36.47 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  34.81 
 
 		 292 aa  142  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  43.67 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  37.19 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  36.41 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  34.02 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  37.71 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  37.7 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  38.24 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  32.98 
 
 		 293 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  38.33 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  40.24 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  35.92 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  36.48 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  36.84 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  33.21 
 
 		 277 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  37.86 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  38.98 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  42.08 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  35.97 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  37.92 
 
 		 246 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  41.3 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  37.5 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  38.7 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  40.26 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  42.21 
 
 		 244 aa  132  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  33.58 
 
 		 274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 296 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  37.66 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  33.7 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  36.09 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  32.73 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  41.1 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 287 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>