More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1653 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  58.21 
 
 		 287 aa  295  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  55.68 
 
 		 293 aa  279  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  53.48 
 
 		 292 aa  277  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  54.78 
 
 		 315 aa  276  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  55.56 
 
 		 288 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  56.37 
 
 		 268 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  53.14 
 
 		 278 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  53.14 
 
 		 278 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  53.14 
 
 		 278 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  53.36 
 
 		 297 aa  268  8.999999999999999e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  55.47 
 
 		 295 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  54.24 
 
 		 294 aa  266  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  54.1 
 
 		 292 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  51.66 
 
 		 280 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  55.3 
 
 		 296 aa  262  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  52.52 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.85 
 
 		 268 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  52.55 
 
 		 306 aa  260  2e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  52.99 
 
 		 298 aa  259  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  56.98 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  52.31 
 
 		 274 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  51.47 
 
 		 277 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  54.07 
 
 		 282 aa  254  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  54.98 
 
 		 309 aa  254  9e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  54.14 
 
 		 294 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  50.55 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  54.14 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  53.78 
 
 		 303 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  51.99 
 
 		 306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  52.69 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  54.96 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  53.18 
 
 		 294 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  52.63 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  51.12 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  53.01 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  51.88 
 
 		 311 aa  249  6e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  55.51 
 
 		 290 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  53.85 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  53.33 
 
 		 345 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  53.85 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  53.85 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  53.08 
 
 		 298 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  53.16 
 
 		 308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  48.54 
 
 		 280 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  54.29 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  48.89 
 
 		 296 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  52.31 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  55.73 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  55.98 
 
 		 309 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  54.62 
 
 		 312 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  54.62 
 
 		 310 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  54.23 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  54.23 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  54.23 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  55.25 
 
 		 797 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  49.63 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  53.31 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  48.94 
 
 		 339 aa  222  6e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  48.53 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  50.58 
 
 		 285 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.45 
 
 		 325 aa  215  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  41.36 
 
 		 366 aa  213  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  46.89 
 
 		 281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  45.93 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.93 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  36.58 
 
 		 406 aa  174  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  43.13 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  37.69 
 
 		 253 aa  162  9e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  37.92 
 
 		 346 aa  160  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  37.68 
 
 		 246 aa  158  8e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  41.03 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  34.51 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  34.51 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  35.09 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  35.85 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  33.98 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  41.44 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  34.16 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  36.26 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  35.85 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  38.04 
 
 		 256 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  33.59 
 
 		 264 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  30.43 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  30.94 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 252 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  35.71 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  37.36 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  36.29 
 
 		 244 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  38.52 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  35.8 
 
 		 242 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  32.86 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  36.3 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  33.85 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  35.14 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  34.09 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  36.63 
 
 		 249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  33.58 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  32.96 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>