More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1150 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
285 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  69.89 
 
 
296 aa  361  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  65.66 
 
 
268 aa  354  6.999999999999999e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  65.27 
 
 
294 aa  346  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  70.2 
 
 
305 aa  345  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  63.36 
 
 
280 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  62.45 
 
 
292 aa  328  8e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  62.06 
 
 
278 aa  322  6e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  61.66 
 
 
278 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  61.66 
 
 
278 aa  319  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  61.05 
 
 
306 aa  310  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  59.7 
 
 
306 aa  303  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  57.09 
 
 
296 aa  300  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  59.14 
 
 
299 aa  299  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  57.31 
 
 
274 aa  277  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  56.93 
 
 
282 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  54.51 
 
 
279 aa  268  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  56.86 
 
 
276 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  52.73 
 
 
293 aa  265  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  54.23 
 
 
292 aa  259  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  56.42 
 
 
311 aa  258  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  53.79 
 
 
287 aa  257  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  54.95 
 
 
290 aa  255  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  55.92 
 
 
290 aa  253  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  51.45 
 
 
315 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  52.19 
 
 
297 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  53.57 
 
 
309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  54.94 
 
 
303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  50.57 
 
 
339 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  50.79 
 
 
291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  48.73 
 
 
292 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  47.04 
 
 
308 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  49.61 
 
 
268 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  48.28 
 
 
299 aa  225  6e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  48.83 
 
 
293 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  51.62 
 
 
294 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.81 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  48.55 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  49.4 
 
 
303 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  46.82 
 
 
294 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  43.82 
 
 
280 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  46.72 
 
 
294 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  47.45 
 
 
288 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  45.96 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  48.83 
 
 
309 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  47.84 
 
 
304 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  47.84 
 
 
362 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  47.84 
 
 
362 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  45.96 
 
 
345 aa  208  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  42.28 
 
 
298 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  45.39 
 
 
298 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  43.82 
 
 
282 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  44.81 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  46.88 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  44.65 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  39.08 
 
 
366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  43.53 
 
 
274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  44 
 
 
281 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  42.55 
 
 
314 aa  195  7e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  44.4 
 
 
311 aa  192  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  43.64 
 
 
281 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  43.59 
 
 
312 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 
310 aa  189  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  43.7 
 
 
312 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  43.7 
 
 
312 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  43.7 
 
 
312 aa  188  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 
797 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  31.13 
 
 
406 aa  145  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  33.21 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  33.21 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  32.23 
 
 
234 aa  138  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  30.48 
 
 
252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  34.78 
 
 
253 aa  135  9e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  30.57 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  35.36 
 
 
254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  35.04 
 
 
231 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  33.08 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  33.97 
 
 
346 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  37.59 
 
 
250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  32.68 
 
 
256 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  32.84 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  32.79 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  37.93 
 
 
236 aa  126  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  36.61 
 
 
257 aa  125  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  36.56 
 
 
266 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  35.06 
 
 
252 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  32.21 
 
 
253 aa  122  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  38.06 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  28.36 
 
 
243 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  32.39 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  27.89 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  29.3 
 
 
246 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  32.94 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  35.21 
 
 
253 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  30.31 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  31.7 
 
 
251 aa  116  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  36.22 
 
 
278 aa  115  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  36.73 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  36.4 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>