More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17240 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  100 
 
 
325 aa  644    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  53.21 
 
 
279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  52.69 
 
 
292 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  49.48 
 
 
311 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  53.21 
 
 
309 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  51.6 
 
 
292 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  50.36 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  51.06 
 
 
278 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  51.77 
 
 
280 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  50.71 
 
 
278 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  50.71 
 
 
278 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  50.37 
 
 
293 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  49.82 
 
 
297 aa  245  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.09 
 
 
268 aa  242  7.999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  53.7 
 
 
290 aa  238  9e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 
294 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  52.31 
 
 
303 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  48.25 
 
 
274 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  49.33 
 
 
296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  50.38 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  48.73 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  47.47 
 
 
314 aa  233  3e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  45.71 
 
 
287 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  44.56 
 
 
280 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  50.53 
 
 
290 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  48.34 
 
 
296 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  47.78 
 
 
295 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  45.99 
 
 
299 aa  225  9e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  46.81 
 
 
305 aa  222  8e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  50.56 
 
 
276 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  44.18 
 
 
306 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  46.45 
 
 
291 aa  215  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  44.85 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  45.05 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  47.51 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  49.02 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  45.58 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  45.82 
 
 
298 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  46.95 
 
 
304 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  45.82 
 
 
298 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  44.94 
 
 
306 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  46.95 
 
 
362 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  46.95 
 
 
362 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  45.96 
 
 
339 aa  208  9e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  45.16 
 
 
281 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  45 
 
 
277 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  45.39 
 
 
338 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  41.5 
 
 
298 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  46.69 
 
 
308 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  49.42 
 
 
285 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  50.56 
 
 
294 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  43.57 
 
 
274 aa  206  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  46.15 
 
 
293 aa  205  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  45.62 
 
 
311 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  43.77 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  46.58 
 
 
312 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  46.58 
 
 
312 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  46.58 
 
 
312 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  46.23 
 
 
312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  46.23 
 
 
310 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  41.84 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  43.42 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  45.55 
 
 
797 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  42.29 
 
 
281 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  42.91 
 
 
288 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  37.99 
 
 
366 aa  187  3e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  42.76 
 
 
309 aa  186  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  33.68 
 
 
406 aa  149  5e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  32.54 
 
 
346 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  35.46 
 
 
256 aa  126  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  29.41 
 
 
252 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  32.44 
 
 
244 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  32.44 
 
 
244 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  31.77 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  32.25 
 
 
256 aa  116  6e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  33.8 
 
 
250 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  30.94 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  28.41 
 
 
234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  30.71 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  28.32 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  28.93 
 
 
256 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  30.25 
 
 
247 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  34.19 
 
 
259 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 
266 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  35.53 
 
 
236 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  30.69 
 
 
254 aa  109  6e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  33.19 
 
 
248 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  34.96 
 
 
242 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  35.69 
 
 
251 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  30.32 
 
 
257 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  28.2 
 
 
244 aa  108  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  31.7 
 
 
251 aa  107  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  32.3 
 
 
278 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  31.89 
 
 
245 aa  106  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  30.94 
 
 
231 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  29.12 
 
 
253 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  32.44 
 
 
248 aa  103  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  32.08 
 
 
242 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  32.68 
 
 
242 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  34.48 
 
 
253 aa  102  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>