More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2078 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 280 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  69.06 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  71.22 
 
 		 281 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  58.24 
 
 		 282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  56.5 
 
 		 311 aa  265  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  54.84 
 
 		 303 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  54.47 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  53.85 
 
 		 310 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  55.34 
 
 		 312 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  51.97 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  51.78 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  53.48 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  53.48 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  53.48 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  50.56 
 
 		 268 aa  250  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  53.48 
 
 		 797 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  52.49 
 
 		 296 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  52.57 
 
 		 304 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  52.57 
 
 		 362 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  52.57 
 
 		 362 aa  247  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  50.98 
 
 		 288 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  52.17 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  52.17 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  48.54 
 
 		 291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  51.38 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  48.05 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  49.82 
 
 		 338 aa  236  4e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  48.7 
 
 		 308 aa  234  9e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  48.97 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  44.65 
 
 		 297 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  47.78 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  47.91 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.56 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  45.31 
 
 		 311 aa  225  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  43.82 
 
 		 293 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  44 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  45.14 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.03 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  44.44 
 
 		 315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  48.64 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  44.49 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  45.6 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  45.63 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  44.24 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  50.6 
 
 		 290 aa  214  9e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  43.54 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  42.09 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  42.45 
 
 		 306 aa  211  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 		 279 aa  211  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  48.69 
 
 		 294 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  41.7 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  43.13 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  41.7 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  41.7 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  45.9 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.13 
 
 		 339 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  43.61 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  43.82 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  41.85 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  41.28 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  44.94 
 
 		 303 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  45.77 
 
 		 276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  44.72 
 
 		 290 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  41.99 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.36 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  40.58 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  33.11 
 
 		 406 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  34.17 
 
 		 346 aa  149  7e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36.43 
 
 		 253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  34.3 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  34.3 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  37.4 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  33.98 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.64 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  34.11 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  32.84 
 
 		 253 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  31.27 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  33.57 
 
 		 251 aa  133  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  36.29 
 
 		 257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  35.97 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  33.84 
 
 		 251 aa  129  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  32.21 
 
 		 247 aa  129  8.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  32.68 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  32.03 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  35.71 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  32.33 
 
 		 253 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  31.88 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  36.61 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  31.46 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  31.75 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  35.88 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  28.83 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  31.62 
 
 		 245 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  30.74 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  32.18 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  31.54 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  32.03 
 
 		 264 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  30.94 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>