More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1959 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  79.92 
 
 		 246 aa  411  1e-114  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  75.41 
 
 		 251 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  74.49 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  57.96 
 
 		 233 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  54.55 
 
 		 256 aa  246  4e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  51.91 
 
 		 245 aa  242  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  53.07 
 
 		 244 aa  240  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  52.89 
 
 		 248 aa  238  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  46.89 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  55.17 
 
 		 244 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  45.78 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  48.36 
 
 		 245 aa  228  6e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  49.17 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  44.13 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  50.6 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  52.79 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  54.08 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  44.13 
 
 		 247 aa  222  6e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 		 248 aa  222  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  54.11 
 
 		 249 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  48.76 
 
 		 253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  53.16 
 
 		 241 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  53.54 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  50.21 
 
 		 243 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 237 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  53.75 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.79 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  47.19 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  46.91 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  53.22 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 249 aa  213  3.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  47.28 
 
 		 252 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  49.4 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.4 
 
 		 306 aa  209  3e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  48 
 
 		 249 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  42.19 
 
 		 243 aa  208  8e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  51.03 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  44.49 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  52.36 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  47.16 
 
 		 230 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  51.87 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  49.32 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  43.04 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  44.4 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  43.4 
 
 		 254 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  46.91 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  45.23 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  48.29 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  44.7 
 
 		 248 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  43.85 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  44.9 
 
 		 252 aa  192  6e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  43.35 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  41.54 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  46.58 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  44.35 
 
 		 244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  46.58 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  46.58 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  47.01 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  42.44 
 
 		 242 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  47.35 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  45.92 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  37.1 
 
 		 252 aa  182  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  44.81 
 
 		 276 aa  181  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  45.99 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  45.89 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  44.54 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  46.25 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  42.49 
 
 		 248 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  44.54 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  44.54 
 
 		 278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  44.98 
 
 		 243 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  39.08 
 
 		 243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  42.06 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  45.22 
 
 		 284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  42.31 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  44.16 
 
 		 233 aa  179  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  42.31 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  40.35 
 
 		 230 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 		 244 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 		 244 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 		 273 aa  178  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  44.44 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  44.44 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  42.06 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  44.44 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  41.95 
 
 		 254 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  44.44 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  44.44 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  47.62 
 
 		 241 aa  178  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  42.67 
 
 		 243 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  38.2 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>