More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2952 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 264 aa  547  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  60.42 
 
 		 256 aa  301  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  59.17 
 
 		 253 aa  294  9e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  58.75 
 
 		 253 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  57.92 
 
 		 253 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  60 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  57.5 
 
 		 253 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  57.45 
 
 		 251 aa  285  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  59.41 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  44.3 
 
 		 259 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  42.8 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  43.35 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  42.92 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  40.66 
 
 		 257 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  44.12 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  41.78 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  40.33 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  42.54 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  41.05 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  39.47 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  38.53 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  40.43 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  37.04 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  41.7 
 
 		 243 aa  159  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  34.25 
 
 		 303 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  39.3 
 
 		 242 aa  158  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  38.17 
 
 		 256 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  36.73 
 
 		 251 aa  155  9e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  34.41 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  39.57 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  37.25 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  40.17 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  39.57 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  36.86 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  39.91 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  36.73 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  38.86 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  38.86 
 
 		 244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  32.33 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  35.71 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  37.15 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  39.3 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  32.95 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  39.83 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  38.26 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  38.46 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  36.07 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  33.85 
 
 		 304 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  33.85 
 
 		 362 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  33.85 
 
 		 362 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  39.57 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  36.71 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  35.29 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  41.36 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  37.24 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  33.05 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  34.11 
 
 		 295 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  33.59 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  32.68 
 
 		 338 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  37.21 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  35.66 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  35.54 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  38.87 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  31.97 
 
 		 277 aa  141  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  34.1 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  34.29 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  38.33 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  35.12 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  35.08 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  33.59 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  38.68 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  37.6 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  37.33 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  34.41 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  34.41 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  35 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  35.27 
 
 		 292 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  32.95 
 
 		 345 aa  138  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  34.16 
 
 		 245 aa  138  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  36.29 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  34.41 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  35.08 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  33.2 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  34.41 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  34.41 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  35.98 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  34.01 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  34.41 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  32.82 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  32.31 
 
 		 311 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  34.57 
 
 		 241 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>