More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1401 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
266 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  66.25 
 
 
259 aa  322  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  65 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  63.03 
 
 
259 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  55.7 
 
 
253 aa  268  8e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  53.19 
 
 
242 aa  260  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  53.85 
 
 
248 aa  255  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  54.98 
 
 
236 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  51.48 
 
 
254 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  38.21 
 
 
251 aa  198  7e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  36.14 
 
 
257 aa  186  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  44.4 
 
 
253 aa  186  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  43.03 
 
 
254 aa  185  6e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  42.28 
 
 
256 aa  185  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  46.15 
 
 
231 aa  185  6e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  44.19 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  40.73 
 
 
257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  45.31 
 
 
250 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  35.43 
 
 
252 aa  169  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  37.6 
 
 
247 aa  169  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  40.33 
 
 
264 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  37.96 
 
 
251 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  44.67 
 
 
233 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  40.71 
 
 
256 aa  166  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  38.37 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 
251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  37.25 
 
 
269 aa  163  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  39.11 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  39.13 
 
 
244 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  37.39 
 
 
244 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  38.78 
 
 
253 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  37.39 
 
 
244 aa  162  6e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  40.16 
 
 
245 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  38.37 
 
 
253 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  35.63 
 
 
242 aa  159  4e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  38.86 
 
 
245 aa  159  4e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  38.15 
 
 
241 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  38.17 
 
 
253 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  40.17 
 
 
251 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 
245 aa  156  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  33.6 
 
 
237 aa  156  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  37.76 
 
 
253 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 
243 aa  151  8e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  38.82 
 
 
256 aa  151  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  41.2 
 
 
248 aa  150  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  31.85 
 
 
283 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  42.68 
 
 
251 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  37 
 
 
275 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  35.86 
 
 
245 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  33.07 
 
 
253 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  34.68 
 
 
248 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  34.94 
 
 
246 aa  148  9e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  37.59 
 
 
271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  37.66 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  39 
 
 
244 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  31.65 
 
 
256 aa  145  6e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  38.02 
 
 
242 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  35.42 
 
 
295 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  36.15 
 
 
266 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  39.13 
 
 
261 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  34.52 
 
 
256 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  37.66 
 
 
245 aa  142  8e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  39.29 
 
 
256 aa  141  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  34 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  32.77 
 
 
251 aa  140  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  36.9 
 
 
304 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  33.1 
 
 
292 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  36.14 
 
 
252 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  35.96 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  36.9 
 
 
362 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  36.9 
 
 
362 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  33.69 
 
 
338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  30.53 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  40.25 
 
 
246 aa  138  7e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  34.85 
 
 
303 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  36.55 
 
 
242 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  34.26 
 
 
242 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  36.36 
 
 
298 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  36.59 
 
 
293 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  33.46 
 
 
242 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  34.25 
 
 
245 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  35.09 
 
 
298 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  34.25 
 
 
242 aa  137  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  36.67 
 
 
308 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  33.68 
 
 
345 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  40.65 
 
 
246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  34.26 
 
 
241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  34.69 
 
 
241 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  39.17 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  37.7 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  34.52 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  34.89 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0479  Silent information regulator protein Sir2  38.62 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441924 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  34.5 
 
 
262 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  33.07 
 
 
242 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  37.7 
 
 
249 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  35.46 
 
 
268 aa  132  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.994892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>