More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0479 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0479  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
248 aa  492  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  38.67 
 
 
244 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  40.25 
 
 
248 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  42.17 
 
 
251 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  42.11 
 
 
265 aa  151  8.999999999999999e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  39.32 
 
 
244 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  39.74 
 
 
269 aa  148  8e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  38.1 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  36.4 
 
 
251 aa  145  6e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  39.29 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  33.76 
 
 
242 aa  144  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  40.09 
 
 
248 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  39.23 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  39.09 
 
 
248 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  39.51 
 
 
256 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  40.52 
 
 
237 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  43.06 
 
 
250 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  39.02 
 
 
266 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  37.18 
 
 
245 aa  137  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  37.18 
 
 
243 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  43.04 
 
 
241 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  41.33 
 
 
244 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  41.92 
 
 
233 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  39.58 
 
 
249 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  43.06 
 
 
254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  40.69 
 
 
232 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  38.27 
 
 
243 aa  134  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  41.49 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  40.45 
 
 
247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  32.9 
 
 
247 aa  133  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  36.96 
 
 
266 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36.14 
 
 
253 aa  132  5e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  41.2 
 
 
244 aa  132  6e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12340  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  42.15 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
245 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  37.5 
 
 
248 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  41.3 
 
 
226 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  40.43 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  35.5 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  42.17 
 
 
250 aa  130  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  36.62 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  34.73 
 
 
249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  35.32 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  36.1 
 
 
249 aa  128  7.000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  37.13 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  37.07 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  37.29 
 
 
235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  37.87 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  42.17 
 
 
251 aa  126  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  35.27 
 
 
259 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  37.04 
 
 
252 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  42.93 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  38.96 
 
 
237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  35.9 
 
 
231 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  36.51 
 
 
233 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  37.45 
 
 
254 aa  125  5e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  33.91 
 
 
230 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  41.12 
 
 
250 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  35.17 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  39 
 
 
258 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  34.04 
 
 
235 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  35.66 
 
 
252 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  38.74 
 
 
259 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  34.5 
 
 
246 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 
253 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  38.72 
 
 
256 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  40.58 
 
 
249 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  40.87 
 
 
241 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  37.93 
 
 
232 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  32.67 
 
 
245 aa  123  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  37.06 
 
 
246 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  39.21 
 
 
245 aa  122  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  35.47 
 
 
278 aa  122  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  33.8 
 
 
241 aa  122  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  35.9 
 
 
278 aa  122  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  37.85 
 
 
242 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  35.29 
 
 
248 aa  121  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  36.67 
 
 
273 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  35.47 
 
 
276 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  34.4 
 
 
243 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  35.47 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  38.28 
 
 
242 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  40.1 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  34.38 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  37.85 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  34.04 
 
 
237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  34.38 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  30.84 
 
 
251 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  40.09 
 
 
306 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  33.04 
 
 
252 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
251 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  35 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  35.68 
 
 
239 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  32 
 
 
253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  36.7 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  33.47 
 
 
249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  35.83 
 
 
273 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  35.83 
 
 
273 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  31.71 
 
 
234 aa  119  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  35.83 
 
 
273 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0564369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>