More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3172 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 244 aa  502  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  54.81 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  55.65 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  47.33 
 
 		 248 aa  221  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  48.71 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  49.14 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  49.8 
 
 		 256 aa  215  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  46.64 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  46.91 
 
 		 244 aa  208  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  43.72 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  46.86 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  47.62 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  44.35 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  44.87 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  41.67 
 
 		 246 aa  182  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  45.34 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  42.62 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  46.85 
 
 		 251 aa  180  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  44.4 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  41.67 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  38.49 
 
 		 242 aa  175  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  43.61 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  41.38 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  46.67 
 
 		 249 aa  166  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  41.56 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  41.42 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  41.23 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  40.43 
 
 		 231 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  39.27 
 
 		 266 aa  158  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  38.34 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  37.89 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  41.18 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  40.89 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  41.84 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  37.65 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  41.39 
 
 		 250 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  36.43 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  38.49 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  39.26 
 
 		 245 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  39.82 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  38.34 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  37.7 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  38.53 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  35.74 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  39.21 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  34.57 
 
 		 262 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  36.73 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  35.66 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  39.39 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  38.22 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  40.76 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  38.14 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  35.27 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  36.48 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  36.1 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  39.57 
 
 		 256 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  38.6 
 
 		 232 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  36.11 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  37.3 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  37.86 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  36.56 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  36.96 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  37.12 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  37.12 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  37.12 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  37.12 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  38.72 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  37.12 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  36.17 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  36.78 
 
 		 263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  36.52 
 
 		 276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  35.62 
 
 		 242 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  42.78 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  36.09 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  37.07 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  37.07 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  37.34 
 
 		 243 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  37.77 
 
 		 243 aa  129  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 273 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 273 aa  128  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 		 243 aa  128  8.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  32.22 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  34.82 
 
 		 259 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  37.07 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  34.89 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  35.29 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  37.23 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  36.59 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  36.23 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  36.59 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  34.55 
 
 		 279 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  35.93 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>