More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4088 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
244 aa  500  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  42.8 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  42.8 
 
 
243 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  42.92 
 
 
233 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  41 
 
 
248 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  41.98 
 
 
235 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  43.15 
 
 
244 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  42.42 
 
 
243 aa  168  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  41.53 
 
 
237 aa  168  8e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  43.83 
 
 
278 aa  168  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  42.55 
 
 
273 aa  164  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  40.85 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  40.85 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  40.85 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  40.85 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  40.85 
 
 
273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  38.98 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  41.45 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  40.93 
 
 
278 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  40.93 
 
 
278 aa  160  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  40.93 
 
 
256 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  40.93 
 
 
278 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  42.74 
 
 
235 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  41.35 
 
 
276 aa  158  6e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  42.37 
 
 
245 aa  158  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  40.77 
 
 
273 aa  158  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  40.77 
 
 
279 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  40.77 
 
 
279 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  40.77 
 
 
273 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  40.77 
 
 
279 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  43.72 
 
 
247 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  40.77 
 
 
279 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  40.77 
 
 
279 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  40.77 
 
 
273 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  39.75 
 
 
248 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  39.08 
 
 
249 aa  157  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  40.51 
 
 
239 aa  156  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  41.81 
 
 
250 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  42.29 
 
 
232 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  41.77 
 
 
251 aa  156  3e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  39.44 
 
 
276 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  37.34 
 
 
251 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  39.39 
 
 
242 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  40.93 
 
 
276 aa  155  6e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  42.29 
 
 
226 aa  155  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  40.87 
 
 
269 aa  154  9e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  40.2 
 
 
245 aa  154  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 
233 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  40.79 
 
 
251 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  41.03 
 
 
237 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  40.74 
 
 
253 aa  153  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  41.6 
 
 
241 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  40.76 
 
 
254 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  41.74 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  41.74 
 
 
243 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 
230 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  41.74 
 
 
243 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 
244 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  40.08 
 
 
249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  41.32 
 
 
243 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  40.18 
 
 
249 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  39.48 
 
 
232 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  37.61 
 
 
246 aa  150  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  40.18 
 
 
249 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  40.6 
 
 
243 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  38.94 
 
 
245 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  40.6 
 
 
240 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  40 
 
 
246 aa  149  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  40.6 
 
 
258 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  42.65 
 
 
260 aa  148  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  38.03 
 
 
284 aa  148  7e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  40.5 
 
 
248 aa  148  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  41.53 
 
 
246 aa  148  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  37.73 
 
 
259 aa  148  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  39.92 
 
 
254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  40.38 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  42.58 
 
 
260 aa  146  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  39.42 
 
 
241 aa  146  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  36.55 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 
246 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 
246 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  38.43 
 
 
259 aa  145  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  40.43 
 
 
254 aa  145  5e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  35.37 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  40.33 
 
 
244 aa  144  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0479  Silent information regulator protein Sir2  39.32 
 
 
248 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441924 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  42.67 
 
 
276 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  40.42 
 
 
253 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  39.66 
 
 
234 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  38.84 
 
 
249 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  38.5 
 
 
231 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  38.29 
 
 
242 aa  143  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  38.4 
 
 
243 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  37.56 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  38.3 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  41.03 
 
 
243 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  39.32 
 
 
239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12340  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  38.72 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  38.25 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>