More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4025 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  68.53 
 
 		 260 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  68.1 
 
 		 260 aa  308  8e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  58.75 
 
 		 245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  53.82 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  56.22 
 
 		 249 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  56.65 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  55.13 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  53.97 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  53.02 
 
 		 244 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  53.81 
 
 		 248 aa  226  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  51.05 
 
 		 256 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  50.21 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  53.02 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  45.83 
 
 		 249 aa  205  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  46.22 
 
 		 249 aa  202  4e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  43.67 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  45.99 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  46.19 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  48.75 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  45.2 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.38 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  45.71 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  41.46 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  41.11 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  46.03 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  46.03 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  46.03 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  43.62 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  44.12 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  42.8 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  47.28 
 
 		 241 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  44.17 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  42.86 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  36.59 
 
 		 242 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 262 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  39.68 
 
 		 262 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  44.72 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  45.68 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  41.89 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  40.96 
 
 		 245 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  43.75 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  46.25 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  44.16 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  40.78 
 
 		 273 aa  165  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  46.12 
 
 		 236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  42.65 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  39.74 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  37.4 
 
 		 245 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  40.27 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  38.68 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  38.43 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  37.55 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  40.25 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  37.7 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  35.96 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  37.23 
 
 		 230 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  37.44 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  40.87 
 
 		 230 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  38.03 
 
 		 244 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  42.31 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  39.02 
 
 		 230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  38.72 
 
 		 243 aa  147  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  38.22 
 
 		 243 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  40.52 
 
 		 237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  41.04 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  36.24 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  38.84 
 
 		 279 aa  146  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  43.63 
 
 		 226 aa  145  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  37 
 
 		 273 aa  145  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  41.29 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  37 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  37 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  37 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  37 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  37 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  37 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  37 
 
 		 279 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 		 237 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  41.26 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 		 246 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  40.95 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  45.7 
 
 		 225 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  36.78 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  39.57 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  38.6 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  32.38 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  40.85 
 
 		 241 aa  143  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  35.68 
 
 		 278 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  37.28 
 
 		 248 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  37.28 
 
 		 254 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  37.39 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  37.2 
 
 		 279 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>