More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0207 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 234 aa  477  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  65.67 
 
 		 233 aa  311  6.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  65.82 
 
 		 239 aa  301  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  60.7 
 
 		 235 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  61.57 
 
 		 232 aa  268  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  55.9 
 
 		 232 aa  255  3e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  53.51 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  55.22 
 
 		 243 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  52.81 
 
 		 243 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  53.48 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  53.25 
 
 		 243 aa  241  5e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  51.52 
 
 		 259 aa  240  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  51.95 
 
 		 243 aa  239  2e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  53.54 
 
 		 235 aa  236  3e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  51.3 
 
 		 276 aa  235  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  56.31 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  51.3 
 
 		 276 aa  232  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  53.88 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  51.75 
 
 		 273 aa  231  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  51.52 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  52.34 
 
 		 237 aa  228  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  51.32 
 
 		 278 aa  228  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  51.32 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  51.34 
 
 		 276 aa  228  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  52.14 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  50.88 
 
 		 278 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  55.08 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  52.99 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  54.01 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  52.42 
 
 		 230 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  54.43 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  54.43 
 
 		 243 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  50.44 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  54.24 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  50.44 
 
 		 279 aa  224  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  50.44 
 
 		 279 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  50.44 
 
 		 279 aa  224  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  52.63 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  50.44 
 
 		 279 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  50.44 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  50.44 
 
 		 279 aa  224  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  50.44 
 
 		 273 aa  225  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  54.01 
 
 		 246 aa  225  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  54.24 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  54.01 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  52.61 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  49.78 
 
 		 241 aa  222  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  50.64 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  46.75 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  52.32 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  51.95 
 
 		 253 aa  215  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  51.52 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2612  NAD-dependent deacetylase  57.27 
 
 		 228 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000726932 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  50.43 
 
 		 276 aa  210  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3226  NAD-dependent deacetylase  54.19 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3964  NAD-dependent deacetylase  54.19 
 
 		 230 aa  208  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  49.57 
 
 		 248 aa  207  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2216  silent information regulator protein Sir2  52.16 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2492  Silent information regulator protein Sir2  52.16 
 
 		 235 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  44.4 
 
 		 251 aa  174  8e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  47.94 
 
 		 235 aa  173  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  44.35 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1453  NAD-dependent deacetylase  40.19 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0321606  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  43.46 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  40.79 
 
 		 230 aa  169  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  48.94 
 
 		 230 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  44.39 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  47.87 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  44.13 
 
 		 230 aa  164  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1487  Silent information regulator protein Sir2  44.39 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.72672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  46.84 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  49.46 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  47.54 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  39.68 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  43.04 
 
 		 251 aa  159  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  41.15 
 
 		 245 aa  158  6e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  48.08 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1071  NAD-dependent deacetylase  40.1 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.202923  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1194  NAD-dependent deacetylase  40.1 
 
 		 233 aa  154  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0597441  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  43.69 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  40.77 
 
 		 233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  45.19 
 
 		 241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  41.55 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  43.89 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  39.83 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1154  conserved hypothetical protein, putative NAD-dependent deacetylase  37.56 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000113398  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  42.05 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  42.36 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  37.82 
 
 		 227 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  45.13 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  40.85 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>