More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1314 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 273 aa  546  1e-154  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  57.85 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  51.71 
 
 		 237 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.94 
 
 		 306 aa  237  1e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.78 
 
 		 251 aa  232  6e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  48.58 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  51.49 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  51.49 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  51.06 
 
 		 237 aa  228  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  50.85 
 
 		 236 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  48.9 
 
 		 266 aa  219  5e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  50.85 
 
 		 236 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  51.24 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  49.39 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  47.98 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  46.25 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  45.83 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  49.8 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  47.62 
 
 		 243 aa  208  7e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  53.12 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  47.74 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  47.43 
 
 		 251 aa  205  5e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  46.27 
 
 		 248 aa  205  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  45.64 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  48.37 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  42.69 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  45.12 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  43.82 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  45.93 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  44.4 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  44.67 
 
 		 252 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  44.63 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  42.91 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  45 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  39.6 
 
 		 242 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  48.91 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  45.7 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  44.95 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  44.77 
 
 		 245 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  44.8 
 
 		 256 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  41.92 
 
 		 265 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  42.8 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  42.68 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  39.92 
 
 		 245 aa  172  5.999999999999999e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  41.06 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  39.93 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  43.97 
 
 		 260 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  43.97 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  41.38 
 
 		 256 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  41.98 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  42.8 
 
 		 234 aa  156  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  42.39 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  38 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  37.9 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  41.15 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  38.98 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  40.17 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  44.17 
 
 		 226 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  43.89 
 
 		 234 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  41.81 
 
 		 230 aa  151  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  39.27 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  40.24 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  41.04 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  40.93 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  40.33 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  42.34 
 
 		 237 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  42.06 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  41.87 
 
 		 237 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  37.9 
 
 		 240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  39.44 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  39.68 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  41.95 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  39.07 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 248 aa  145  9e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  35.43 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  39.68 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  39.2 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  45.5 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  38.52 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  36.78 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  38.15 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  38.15 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  37.14 
 
 		 242 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  39.2 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  39.53 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  42.86 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  41.87 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  39.27 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  39.27 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  39.27 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  37.2 
 
 		 241 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  39.27 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  39.27 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  39.27 
 
 		 279 aa  142  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  37.75 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  39.27 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  37.97 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>