More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0601 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 249 aa  518  1e-146  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  60.94 
 
 		 266 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  47.01 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  49.15 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  49.79 
 
 		 256 aa  230  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  45.71 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  44.13 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  52.1 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  47.46 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  44.9 
 
 		 251 aa  222  4e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  45.21 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  47.52 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  48.12 
 
 		 246 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  47.52 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  48.32 
 
 		 249 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  47.44 
 
 		 244 aa  208  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  47.48 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  45.34 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  44.35 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  45.78 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  43.41 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  46.15 
 
 		 249 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  44.96 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  43.82 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  45.15 
 
 		 284 aa  199  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  40.64 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  41.27 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  46.32 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  43.37 
 
 		 244 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  43.57 
 
 		 237 aa  195  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  43.08 
 
 		 258 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  43.57 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  43.57 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  42.91 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  43.22 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  44.39 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  43.5 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  41.32 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  47.23 
 
 		 243 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  46 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  44.89 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  42.5 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  46.61 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  44.59 
 
 		 235 aa  180  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  48.56 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  47.6 
 
 		 259 aa  178  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  48.08 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  41.22 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  46.41 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  41.67 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  44.26 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  44.21 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  44.21 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  41.1 
 
 		 236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  44.23 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  40.57 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  41.88 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  43.53 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  43.72 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  45.61 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  43.48 
 
 		 278 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  42.44 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  43.75 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  44.16 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  44.07 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  42.31 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  45.24 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  45.3 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  40.5 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  37.18 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  42.24 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  43.78 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  43.78 
 
 		 278 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  39.75 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  43.78 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  42.39 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  45.71 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  45.71 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  45.71 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  45.71 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  45.71 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  42.74 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  45.71 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  45.71 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  40.95 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  41.03 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  45.71 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  40.17 
 
 		 230 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  40.09 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  41.3 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  42.58 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  39.32 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  40.87 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  39.83 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  39.32 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>