More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1604 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  99.64 
 
 
278 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
278 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  99.64 
 
 
278 aa  578  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  82.16 
 
 
278 aa  475  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  77.32 
 
 
276 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  76.21 
 
 
276 aa  441  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  74.91 
 
 
273 aa  419  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  74.24 
 
 
279 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  74.24 
 
 
279 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  74.24 
 
 
273 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  74.24 
 
 
273 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  74.24 
 
 
279 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  74.24 
 
 
279 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  74.24 
 
 
273 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  74.24 
 
 
279 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  73.11 
 
 
273 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  73.11 
 
 
273 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  73.11 
 
 
273 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  73.11 
 
 
273 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  73.11 
 
 
273 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  74.72 
 
 
276 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  76.33 
 
 
276 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  66.12 
 
 
243 aa  337  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  67.25 
 
 
243 aa  334  7.999999999999999e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  62.87 
 
 
259 aa  323  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  64.47 
 
 
237 aa  316  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  60.87 
 
 
251 aa  301  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  59.83 
 
 
235 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  58.12 
 
 
243 aa  292  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  58.7 
 
 
242 aa  288  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  58.62 
 
 
235 aa  276  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  58.77 
 
 
248 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  58.52 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  58.52 
 
 
240 aa  271  9e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  57.89 
 
 
243 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  57.89 
 
 
243 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  59.21 
 
 
248 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  57.64 
 
 
243 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  57.46 
 
 
243 aa  269  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  57.21 
 
 
243 aa  267  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  57.89 
 
 
247 aa  267  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  56.58 
 
 
254 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  56.77 
 
 
258 aa  266  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  58.08 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  57.89 
 
 
246 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  57.89 
 
 
246 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  55.46 
 
 
241 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  55.7 
 
 
233 aa  254  8e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  55.24 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  55.65 
 
 
232 aa  248  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  51.5 
 
 
232 aa  238  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  53.36 
 
 
239 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  50.21 
 
 
246 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  50.43 
 
 
237 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  51.32 
 
 
234 aa  228  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  52.68 
 
 
226 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  49.78 
 
 
241 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  50.86 
 
 
239 aa  224  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  51.32 
 
 
230 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  48.28 
 
 
237 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3226  NAD-dependent deacetylase  50.88 
 
 
230 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3964  NAD-dependent deacetylase  50.88 
 
 
230 aa  201  9e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  53.3 
 
 
233 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  54.84 
 
 
235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  55.05 
 
 
230 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  53.03 
 
 
233 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2492  Silent information regulator protein Sir2  50.65 
 
 
235 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2216  silent information regulator protein Sir2  50.65 
 
 
235 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2612  NAD-dependent deacetylase  48.9 
 
 
228 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000726932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  44.49 
 
 
244 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  43.62 
 
 
251 aa  186  3e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  44.59 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  44.54 
 
 
269 aa  180  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  50.98 
 
 
229 aa  180  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  49.28 
 
 
225 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  43.83 
 
 
227 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  43.88 
 
 
251 aa  175  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  42.19 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  44.05 
 
 
233 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  52.15 
 
 
226 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  48.48 
 
 
242 aa  171  9e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  51.06 
 
 
230 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  48.24 
 
 
234 aa  168  8e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  48.99 
 
 
229 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  42.17 
 
 
245 aa  167  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  43.78 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  41.18 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  41.8 
 
 
266 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  41.38 
 
 
249 aa  163  3e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  39.91 
 
 
230 aa  162  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  40.93 
 
 
244 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  41.67 
 
 
243 aa  159  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  43.23 
 
 
248 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  39.81 
 
 
245 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 
264 aa  155  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1154  conserved hypothetical protein, putative NAD-dependent deacetylase  36.09 
 
 
232 aa  153  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000113398  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1194  NAD-dependent deacetylase  40.1 
 
 
233 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0597441  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  36.25 
 
 
242 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1071  NAD-dependent deacetylase  39.6 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.202923  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  40.27 
 
 
241 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>