More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3645 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 243 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  62.01 
 
 		 273 aa  287  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  58.7 
 
 		 276 aa  285  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  60.26 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  60.26 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  58.95 
 
 		 273 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  58.95 
 
 		 273 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  60.26 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  58.95 
 
 		 273 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  60.26 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  60.26 
 
 		 273 aa  281  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  58.95 
 
 		 273 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  60.26 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  58.95 
 
 		 273 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  60.26 
 
 		 273 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  60.26 
 
 		 273 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  58.97 
 
 		 278 aa  274  8e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  58.52 
 
 		 278 aa  273  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  58.52 
 
 		 278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  58.08 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  58.22 
 
 		 276 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  60.7 
 
 		 235 aa  272  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  58.22 
 
 		 276 aa  271  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  56.6 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  56.65 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  58.95 
 
 		 237 aa  265  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  59.57 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  56.6 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1652  NAD-dependent deacetylase  57.69 
 
 		 276 aa  262  3e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.730778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  55.9 
 
 		 243 aa  259  4e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  53.65 
 
 		 243 aa  256  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  58.48 
 
 		 235 aa  255  5e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  55.6 
 
 		 237 aa  254  9e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  55.02 
 
 		 254 aa  254  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  55.46 
 
 		 258 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  55.74 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  55.74 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  57.45 
 
 		 246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  55.32 
 
 		 243 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  54.98 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  55.74 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  54.89 
 
 		 244 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  57.21 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  54.7 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  58.87 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  55.32 
 
 		 243 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  54.89 
 
 		 243 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  54.89 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  54.47 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  57.38 
 
 		 239 aa  246  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  52.77 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  55.51 
 
 		 239 aa  245  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  55.22 
 
 		 234 aa  244  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  53.25 
 
 		 251 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  51.72 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  54.59 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  51.87 
 
 		 241 aa  240  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  55.02 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  54.15 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2612  NAD-dependent deacetylase  55.17 
 
 		 228 aa  224  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000726932 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3226  NAD-dependent deacetylase  56.77 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3964  NAD-dependent deacetylase  56.77 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  53.51 
 
 		 226 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2492  Silent information regulator protein Sir2  53.88 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.340996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2216  silent information regulator protein Sir2  53.88 
 
 		 235 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.310808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  47.62 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  48.96 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  46.22 
 
 		 244 aa  175  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  44.83 
 
 		 256 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  46.97 
 
 		 229 aa  172  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  43.53 
 
 		 233 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  50.53 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  41.52 
 
 		 230 aa  166  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  46.93 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  46.19 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  42.39 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  40.74 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  47.37 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  46.03 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  48.44 
 
 		 226 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  46.15 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  42.36 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  41.53 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1487  Silent information regulator protein Sir2  38.4 
 
 		 230 aa  158  9e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.72672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  41.2 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  39.13 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  43.78 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  42.44 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  43.72 
 
 		 306 aa  155  6e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  44.61 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  42.31 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  41.56 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1154  conserved hypothetical protein, putative NAD-dependent deacetylase  37.77 
 
 		 232 aa  148  9e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000113398  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  40.6 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  45.21 
 
 		 230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  43.04 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  38.72 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  43.16 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1453  NAD-dependent deacetylase  38.24 
 
 		 232 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0321606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>