More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1260 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 247 aa  497  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  83.33 
 
 		 248 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  63.09 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  60.74 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  50.2 
 
 		 249 aa  249  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  53.04 
 
 		 248 aa  247  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  54.63 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  53.75 
 
 		 243 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  53.02 
 
 		 244 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  53.28 
 
 		 269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  51.98 
 
 		 246 aa  231  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  52.61 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  46.94 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  48.56 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  55.79 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  55.7 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.79 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  52.48 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  50.44 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  47.33 
 
 		 244 aa  221  8e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  50.44 
 
 		 249 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  53.22 
 
 		 284 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  53.81 
 
 		 241 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  50.94 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  46.28 
 
 		 262 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  57.07 
 
 		 249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  47.74 
 
 		 306 aa  215  5.9999999999999996e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  42.92 
 
 		 242 aa  214  8e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  48.22 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  47.13 
 
 		 266 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  46.19 
 
 		 249 aa  211  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  52.81 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  52.81 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  51.53 
 
 		 245 aa  206  3e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  52.28 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  53.06 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  49.37 
 
 		 245 aa  202  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  46.48 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  47.37 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  45.06 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  50.63 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  42.45 
 
 		 248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  46.67 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  46.77 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  42.27 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  49.26 
 
 		 237 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  49.26 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  49.26 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  48.8 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  40.76 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  42.41 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  41.84 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  45.61 
 
 		 236 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  45.18 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  44.93 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  41.23 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  43.67 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  40.76 
 
 		 276 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  46.05 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  43.32 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  42.49 
 
 		 276 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  39.33 
 
 		 256 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  40.83 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  40.83 
 
 		 244 aa  161  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  43.44 
 
 		 242 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  39.04 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  43.03 
 
 		 250 aa  161  9e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  39.91 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  41.04 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  40.93 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  38.7 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  45.18 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  39.22 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  40.59 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  40.34 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  41.7 
 
 		 253 aa  158  8e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  42.72 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  44.31 
 
 		 241 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  41.89 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  35.54 
 
 		 247 aa  155  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  39.13 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  38.37 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  39.56 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  41.67 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  35.24 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  42.74 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  44.32 
 
 		 233 aa  152  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  39.66 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  40.99 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>