More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2262 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  98.85 
 
 		 260 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  69.1 
 
 		 284 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  65.83 
 
 		 245 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  58.23 
 
 		 258 aa  271  6e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  57.48 
 
 		 260 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  56.9 
 
 		 244 aa  255  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  56.41 
 
 		 249 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  55.98 
 
 		 246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  55.98 
 
 		 249 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  49.41 
 
 		 249 aa  218  6e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  52.32 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  52.54 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  50.85 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.44 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  51.06 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  44.94 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  50.87 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  50.73 
 
 		 248 aa  188  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  47.23 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  47.52 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  47.3 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  50 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  47.48 
 
 		 243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  44.66 
 
 		 264 aa  181  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.75 
 
 		 306 aa  181  9.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  42.44 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  46.22 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  45.69 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  41.45 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  45.15 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  45.15 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  45.15 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  42.13 
 
 		 246 aa  176  5e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  37.24 
 
 		 242 aa  175  6e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  48.32 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  42.08 
 
 		 266 aa  175  7e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  41.56 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  45.02 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  40.41 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  43.53 
 
 		 269 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  44.44 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  47.08 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  44.26 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  43.39 
 
 		 273 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  41.03 
 
 		 245 aa  165  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  41.32 
 
 		 245 aa  162  7e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  45.02 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  41.52 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  41.22 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  44.1 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  38.82 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  40.09 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  39.56 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  41.18 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  41.03 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  39.39 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  41.74 
 
 		 279 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  39.06 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  43.7 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  38.2 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  38.03 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  36.96 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  38.53 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  41.51 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  41.73 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  39.41 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  43.4 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  40.5 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  42.79 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  32.47 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  38.36 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1797  NAD-dependent deacetylase  38.7 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0401788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  36.78 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  40.34 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  44.4 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  36.16 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  40.83 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  36.91 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  34.68 
 
 		 256 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  40.34 
 
 		 244 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  43.1 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  37.67 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  39.04 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  40.77 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  39.48 
 
 		 243 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  34.44 
 
 		 241 aa  141  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  41.79 
 
 		 235 aa  141  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  40.34 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  40.96 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  38.74 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  40.44 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>