More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1594 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 259 aa  526  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  88.03 
 
 		 259 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  54.81 
 
 		 244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  47.77 
 
 		 248 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  47.21 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  48.91 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  46.94 
 
 		 247 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  42.98 
 
 		 249 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  45.96 
 
 		 243 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  46.41 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  45.69 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  45.12 
 
 		 256 aa  201  9e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  42.56 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  43.04 
 
 		 269 aa  199  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  46.75 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  47.23 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  44.02 
 
 		 244 aa  195  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  43.62 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  45.91 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  41.88 
 
 		 245 aa  184  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  43.23 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  42.17 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  40.87 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  41.41 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  41.5 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  43.1 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  43.53 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  36.89 
 
 		 242 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  38.78 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  39.61 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  40.43 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  39.06 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  40.74 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  39.3 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  40.34 
 
 		 284 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  38.71 
 
 		 262 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  43.1 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  37.18 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  43.11 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  38.98 
 
 		 243 aa  164  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  39.13 
 
 		 231 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  41.74 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  36.4 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  42.36 
 
 		 276 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  38.68 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  39.05 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  39.35 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  38.94 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  37.9 
 
 		 273 aa  155  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36.21 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  41.05 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  40.08 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  38.26 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  37.96 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  36.14 
 
 		 245 aa  151  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  36.48 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  36.48 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  37.73 
 
 		 244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  33.47 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  44.55 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  37.18 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  35.78 
 
 		 237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  35.78 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  35.81 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  35.74 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  37.5 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  37.5 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  35.54 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  37.5 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  37.5 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  37.5 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  37.5 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  38.74 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  35.66 
 
 		 248 aa  142  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  38.94 
 
 		 235 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  36.25 
 
 		 276 aa  141  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  35.5 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  35.5 
 
 		 237 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  39.9 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  38.03 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  41.99 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  40.39 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  35.06 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  44.04 
 
 		 226 aa  139  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  35.45 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  39.9 
 
 		 259 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  36.84 
 
 		 273 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  36.84 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  36.84 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  36.84 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  37.13 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  36.84 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  36.84 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  36.73 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  36.84 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>