More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1627 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  512  1e-144  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  60.92 
 
 		 250 aa  268  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  58.44 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  58 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  50.42 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  48.33 
 
 		 262 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  54.25 
 
 		 243 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  53.14 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  51.44 
 
 		 251 aa  232  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  47.86 
 
 		 264 aa  229  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  47.27 
 
 		 266 aa  228  9e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  47.98 
 
 		 249 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  49.8 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.22 
 
 		 306 aa  225  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  48.81 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  47.92 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  46.85 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  50.8 
 
 		 260 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  44.9 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  51.26 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  46.8 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  48.96 
 
 		 249 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  48.74 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  47.86 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  46.35 
 
 		 251 aa  209  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  46.96 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  48.43 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  47.3 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.56 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  46.89 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  45.12 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  43.61 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  45.53 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  45.53 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  45.53 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  42.69 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  43.98 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  38.1 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  41.2 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  44.49 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  46.15 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  44.44 
 
 		 245 aa  186  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  40.8 
 
 		 259 aa  185  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  49.59 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  45.3 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  42.91 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  42.98 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  40.23 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  38.1 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  41.91 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  37.55 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  38.22 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  45.38 
 
 		 226 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  40.82 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  40.95 
 
 		 231 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  40.08 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1717  NAD-dependent deacetylase  40.08 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000104436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1642  NAD-dependent deacetylase  40.08 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000907169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  38.21 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  38.08 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  39.63 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  39.67 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  40.8 
 
 		 250 aa  152  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  39.67 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1843  NAD-dependent deacetylase  39.84 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000585877  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  37.65 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  38.71 
 
 		 253 aa  151  8e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2508  NAD-dependent deacetylase  39.84 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000926732  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  37.66 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2621  NAD-dependent deacetylase  39.43 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000617513  normal  0.0318623 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2501  NAD-dependent deacetylase  39.84 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000275677  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  42.86 
 
 		 230 aa  150  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  37.92 
 
 		 243 aa  148  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  37.19 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  40.08 
 
 		 240 aa  148  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1938  NAD-dependent deacetylase  38.68 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  36.82 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  38.02 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  33.49 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1594  NAD-dependent deacetylase  39.34 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000756784  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  39.09 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  43.23 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  37.19 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  41.63 
 
 		 235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  40.45 
 
 		 239 aa  145  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  39.33 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  36.76 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  36.76 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  36.76 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  36.36 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>