More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4570 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
236 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  87.66 
 
 
236 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  78.3 
 
 
237 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  78.3 
 
 
237 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  77.87 
 
 
237 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  65.96 
 
 
237 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  50.85 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  50.64 
 
 
251 aa  237  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  50.21 
 
 
264 aa  232  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  49.79 
 
 
262 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  46.78 
 
 
262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.89 
 
 
306 aa  210  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  47.01 
 
 
269 aa  210  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  47.6 
 
 
241 aa  209  4e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  46.61 
 
 
246 aa  207  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  41.15 
 
 
266 aa  205  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  45.34 
 
 
251 aa  204  1e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  47.41 
 
 
243 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  46.29 
 
 
248 aa  201  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  43.23 
 
 
251 aa  201  7e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  49.34 
 
 
260 aa  201  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  47.64 
 
 
250 aa  201  8e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  47.03 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  46.55 
 
 
249 aa  199  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  46.12 
 
 
249 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  46.98 
 
 
246 aa  197  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  48.91 
 
 
244 aa  197  9e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  45.69 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  45.41 
 
 
233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  44.78 
 
 
249 aa  194  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  41.3 
 
 
242 aa  193  2e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 
244 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  42.44 
 
 
249 aa  191  7e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  42.42 
 
 
252 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  45.34 
 
 
258 aa  188  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  46.12 
 
 
284 aa  184  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  41.63 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  43.59 
 
 
255 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  38.26 
 
 
249 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  47.01 
 
 
245 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  39.39 
 
 
245 aa  178  7e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  45.13 
 
 
247 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  40.08 
 
 
265 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  46.12 
 
 
256 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  43.67 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  43.23 
 
 
260 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  44.64 
 
 
260 aa  169  3e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  38.86 
 
 
244 aa  168  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  40.37 
 
 
230 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  38.2 
 
 
257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  38.79 
 
 
248 aa  165  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  39.32 
 
 
245 aa  160  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  34.8 
 
 
252 aa  158  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  38.05 
 
 
247 aa  158  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  41.55 
 
 
242 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  38.71 
 
 
242 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  36.8 
 
 
248 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  39.48 
 
 
252 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  38.03 
 
 
244 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  38.03 
 
 
244 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  40.38 
 
 
233 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  35.71 
 
 
246 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  35.06 
 
 
233 aa  150  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  38.98 
 
 
258 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  41.28 
 
 
237 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  36.4 
 
 
229 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  36.68 
 
 
254 aa  148  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  36.32 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  42.72 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  38.86 
 
 
250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  33.86 
 
 
273 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  36.87 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  38.56 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  40.17 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  37.13 
 
 
253 aa  146  3e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  36.28 
 
 
248 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  35.02 
 
 
244 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  36.36 
 
 
256 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  34.2 
 
 
243 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  36.4 
 
 
230 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  34.73 
 
 
245 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  37.83 
 
 
230 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 
230 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  37.71 
 
 
234 aa  142  6e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  35.15 
 
 
243 aa  141  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  36.36 
 
 
243 aa  142  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  35.74 
 
 
231 aa  141  7e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  32.75 
 
 
243 aa  141  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  39.08 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2262  NAD-dependent deacetylase  41.43 
 
 
244 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  36.71 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  35.9 
 
 
229 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1717  NAD-dependent deacetylase  41.9 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000712347  normal  0.253477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  36.55 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  39.15 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  32.91 
 
 
259 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  41.4 
 
 
241 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  36.05 
 
 
243 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  37.55 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  43.54 
 
 
232 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>