More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4244 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  100 
 
 		 250 aa  490  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  86 
 
 		 250 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  55.1 
 
 		 252 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  60.92 
 
 		 255 aa  262  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  58.87 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  55.47 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 262 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  51.25 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  50.83 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  54.77 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  53.15 
 
 		 306 aa  227  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  54.2 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  53.53 
 
 		 249 aa  224  8e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  50.23 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  54.74 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  51.03 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  51.24 
 
 		 273 aa  222  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  52.1 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  53.94 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  50.21 
 
 		 237 aa  221  8e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  50.62 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  51.64 
 
 		 244 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  52.34 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  52.23 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  45.97 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  52.87 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  51.65 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  44.58 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  46.28 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  51.42 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  47.13 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  42.26 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  52.28 
 
 		 247 aa  205  5e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  52.87 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  48.71 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  47.64 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  47.64 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  47.64 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  49.58 
 
 		 244 aa  201  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  47.08 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  49.37 
 
 		 256 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  48.87 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  44.24 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  47.93 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  43.1 
 
 		 259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  45.69 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  47.22 
 
 		 245 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  45.68 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  42.37 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  42.68 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  43.52 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 260 aa  171  9e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  45.15 
 
 		 265 aa  168  7e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  41.84 
 
 		 244 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  45.61 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  41.37 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  45.23 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  44.78 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  46.96 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  44.64 
 
 		 232 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  40.76 
 
 		 247 aa  160  3e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  44.77 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  40.82 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  40.82 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  40.51 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  40.82 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  41.81 
 
 		 232 aa  159  5e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  40.82 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  39.32 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  40.82 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  38.66 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  42.92 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  41.22 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  42.28 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  40.41 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  40.41 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 		 273 aa  156  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  43.98 
 
 		 243 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  40.41 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  38.93 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  39.18 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  39.91 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  40 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  40.59 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  39.27 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  39.5 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  39.33 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  41.06 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  40.57 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  39.08 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4319  silent information regulator protein Sir2  59.66 
 
 		 131 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  40.17 
 
 		 231 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  40.08 
 
 		 276 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  39.33 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  39.64 
 
 		 259 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>