More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4137 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  99.58 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  79.57 
 
 		 236 aa  359  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  70.34 
 
 		 237 aa  346  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  78.3 
 
 		 236 aa  346  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.28 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  51.49 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  50.83 
 
 		 306 aa  224  7e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  48.5 
 
 		 243 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  46.78 
 
 		 262 aa  209  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  47.39 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  47.64 
 
 		 250 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  50.44 
 
 		 260 aa  203  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  46.81 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  46.29 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  48.67 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  49.78 
 
 		 244 aa  201  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  43.57 
 
 		 249 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  47.44 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  44.59 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  46.72 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  44.54 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  48.1 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  46.58 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 		 249 aa  195  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  41.67 
 
 		 266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  46.72 
 
 		 244 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  46.03 
 
 		 284 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  48.26 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  39.32 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  43.35 
 
 		 252 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  45.99 
 
 		 258 aa  189  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  46.78 
 
 		 249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  44.16 
 
 		 248 aa  188  7e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  45.92 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  43.16 
 
 		 245 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  42.34 
 
 		 265 aa  185  6e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  40.52 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  49.26 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  47.85 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  45.26 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  45.33 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  45.33 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  46.11 
 
 		 230 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  39.66 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  44.21 
 
 		 245 aa  167  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  40.87 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  38.26 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  40.09 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 		 229 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  37.05 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  38.66 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  37.62 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  42.13 
 
 		 230 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  36.4 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  41.7 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  38.2 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  37.66 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  41.2 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  33.76 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  38.2 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  37.76 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2809  NAD-dependent deacetylase  38.66 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.713265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  40.43 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  39.83 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  35.5 
 
 		 259 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  36.15 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  36.15 
 
 		 244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  42.47 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  38.84 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  40.52 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  39.24 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  35.65 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  41.94 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  37.55 
 
 		 254 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  38.34 
 
 		 279 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  38.34 
 
 		 279 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  38.34 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  38.24 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  37.18 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  39.92 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  38.08 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  41.54 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  43.06 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  43.48 
 
 		 230 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  37.34 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  33.86 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  39.11 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  41.63 
 
 		 239 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  40.26 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  41.86 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  36.4 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  34.78 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  35.71 
 
 		 256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  39.71 
 
 		 248 aa  138  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0294  Silent information regulator protein Sir2  38.96 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>