More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7099 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
253 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  58.82 
 
 
242 aa  295  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  59.41 
 
 
259 aa  289  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  55.7 
 
 
266 aa  268  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  54.39 
 
 
259 aa  252  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  51.46 
 
 
248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  47.33 
 
 
256 aa  235  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  46.03 
 
 
254 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  45.92 
 
 
236 aa  202  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  41.74 
 
 
231 aa  178  9e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  42.15 
 
 
254 aa  176  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  42.49 
 
 
253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  37.14 
 
 
251 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  41.78 
 
 
264 aa  169  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  41.13 
 
 
257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  38.15 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  39.39 
 
 
244 aa  162  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  39.39 
 
 
244 aa  162  7e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  41.85 
 
 
253 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  42.11 
 
 
253 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  39.65 
 
 
247 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  41.78 
 
 
253 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  40.27 
 
 
256 aa  157  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  39.22 
 
 
251 aa  157  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  41.38 
 
 
251 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  39.65 
 
 
253 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  41.88 
 
 
250 aa  156  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  41.42 
 
 
233 aa  155  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  41.38 
 
 
245 aa  154  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  38.89 
 
 
256 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  40.77 
 
 
252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  38.2 
 
 
269 aa  150  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  38.79 
 
 
251 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  38.76 
 
 
271 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  38.26 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  39.47 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  35.85 
 
 
291 aa  145  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  40.09 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  36.09 
 
 
237 aa  145  8.000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  36.51 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  41.2 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  38.66 
 
 
245 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  37.15 
 
 
303 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  38.79 
 
 
253 aa  143  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  38.26 
 
 
248 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  34.76 
 
 
246 aa  141  9e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  36.48 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  35.85 
 
 
292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  37.35 
 
 
242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  36.44 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  34.22 
 
 
295 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  40.68 
 
 
261 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  36.73 
 
 
242 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  41.95 
 
 
248 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  35.56 
 
 
241 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  36.53 
 
 
245 aa  137  2e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  37.55 
 
 
249 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  38.43 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  34.08 
 
 
362 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  34.08 
 
 
362 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  34.08 
 
 
304 aa  135  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  39.37 
 
 
245 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  36.07 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  36.91 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  41.31 
 
 
251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 
278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  36.67 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 
278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  38.43 
 
 
247 aa  133  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  38.02 
 
 
256 aa  132  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  34.44 
 
 
246 aa  132  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  34.94 
 
 
278 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  32.45 
 
 
293 aa  132  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  36.97 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  34.13 
 
 
294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  34.02 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  35.34 
 
 
245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  34.27 
 
 
292 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  34.04 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 
345 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  37.39 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  34.35 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  32.72 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  36.91 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  36.48 
 
 
248 aa  130  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  34.78 
 
 
248 aa  129  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  37.55 
 
 
260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  34.35 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  36.69 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  37.3 
 
 
244 aa  128  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  36.21 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  36.21 
 
 
245 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  33.08 
 
 
293 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  36.64 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  35.29 
 
 
237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  32.96 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  36 
 
 
266 aa  126  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  36.52 
 
 
241 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  36.21 
 
 
242 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  37.07 
 
 
241 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>