More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2529 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 253 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  88.93 
 
 		 253 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  86.96 
 
 		 253 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  83 
 
 		 253 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  75.89 
 
 		 253 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  60.73 
 
 		 256 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  59.17 
 
 		 264 aa  294  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  56.5 
 
 		 251 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  58.4 
 
 		 253 aa  274  9e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  43.83 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  42.62 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  44.49 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  42.56 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  42.86 
 
 		 257 aa  175  6e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  42.73 
 
 		 231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  41.18 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  39.44 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  40.6 
 
 		 242 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  38.78 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  44.16 
 
 		 250 aa  161  7e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  42.11 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  38.08 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  38.08 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  35.6 
 
 		 241 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  37.39 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  35.74 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  41.05 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  40.34 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  36.78 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  38.98 
 
 		 269 aa  148  7e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  37.22 
 
 		 252 aa  148  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  37.75 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  35.89 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  36.59 
 
 		 243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  40 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  37.83 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  37.28 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  37.2 
 
 		 244 aa  146  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  39.51 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  37.78 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  38.37 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  36.69 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  37.75 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  38.82 
 
 		 245 aa  143  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  38.08 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  37.6 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  32.18 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  34.98 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  36.05 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  37.5 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  35.88 
 
 		 273 aa  139  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  36.73 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  33.2 
 
 		 292 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  36.97 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  34.84 
 
 		 237 aa  138  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  36.36 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  35.68 
 
 		 242 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  35.27 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  35.5 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  36.13 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  36.91 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  35.27 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  32.03 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  33.58 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  33.57 
 
 		 311 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  34.22 
 
 		 234 aa  135  9e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  35 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  32.64 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  35.59 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  34.31 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  34.31 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  34.73 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  34.31 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  34.31 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  35.15 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  33.73 
 
 		 246 aa  133  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  35.8 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  35.37 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  32.46 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  34.72 
 
 		 275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  39.3 
 
 		 230 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  36.56 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  37.66 
 
 		 233 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  34.31 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  34.17 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 282 aa  129  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  33.89 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  33.21 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  32.68 
 
 		 280 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  38.12 
 
 		 278 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  37.44 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  30.65 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  35.39 
 
 		 250 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  30.45 
 
 		 345 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  36.69 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  31.27 
 
 		 295 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  34.04 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  34.68 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  38.86 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>