More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1499 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  100 
 
 
251 aa  525  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  81.22 
 
 
257 aa  427  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  45.27 
 
 
236 aa  223  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  38.21 
 
 
266 aa  198  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  36.84 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  39.83 
 
 
242 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  38.4 
 
 
259 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  38.02 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  34.96 
 
 
244 aa  177  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  34.96 
 
 
244 aa  177  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  37.14 
 
 
253 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  38.11 
 
 
248 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  38.56 
 
 
256 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  37.19 
 
 
254 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  35.83 
 
 
231 aa  159  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  34.85 
 
 
252 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  36.13 
 
 
247 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  36.21 
 
 
256 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  35 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  34.13 
 
 
253 aa  152  4e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  38.59 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  34.3 
 
 
251 aa  148  7e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  35.69 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  36.4 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  33.05 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  38.49 
 
 
261 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  35.04 
 
 
256 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  35.21 
 
 
292 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  33.75 
 
 
257 aa  142  6e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  32.13 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  34.18 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  32.47 
 
 
234 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  34.31 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  35.06 
 
 
256 aa  138  7e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  35.25 
 
 
245 aa  138  8.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  36.32 
 
 
246 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  36.03 
 
 
299 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  34.47 
 
 
251 aa  135  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  34.19 
 
 
244 aa  135  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  33.2 
 
 
268 aa  135  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  32.33 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  33.47 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  32.37 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  32.64 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  32.52 
 
 
253 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  34.09 
 
 
291 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  32.33 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  32.33 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  33.97 
 
 
294 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  32.93 
 
 
245 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  31.94 
 
 
293 aa  133  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  32 
 
 
308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  31.4 
 
 
243 aa  132  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  35.22 
 
 
295 aa  132  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  34.75 
 
 
237 aa  132  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  33.59 
 
 
294 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  32.6 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  32.05 
 
 
274 aa  131  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  33.08 
 
 
268 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  35.43 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  32.95 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  33.2 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  31.2 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  31.75 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  32.37 
 
 
251 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  34.16 
 
 
242 aa  128  8.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  31.95 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  33.73 
 
 
252 aa  126  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  33.86 
 
 
253 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  34.82 
 
 
241 aa  125  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  33.62 
 
 
242 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  32.71 
 
 
306 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  32.45 
 
 
311 aa  125  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  35.68 
 
 
278 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  34.3 
 
 
245 aa  124  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  31.56 
 
 
282 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  31.72 
 
 
299 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  29.68 
 
 
296 aa  124  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  34.35 
 
 
254 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  34.22 
 
 
288 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08450  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00520)  35.84 
 
 
2081 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.601211 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1071  Silent information regulator protein Sir2  30.51 
 
 
275 aa  123  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  31.15 
 
 
277 aa  123  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  39.19 
 
 
245 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  33.6 
 
 
303 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  31.09 
 
 
293 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  32.3 
 
 
305 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  33.06 
 
 
248 aa  122  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
292 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 
253 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  34.52 
 
 
253 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  32.92 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  32.95 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  32.31 
 
 
309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  32.92 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  31 
 
 
271 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  30.89 
 
 
315 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  32.93 
 
 
248 aa  118  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>