More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2063 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  67.28 
 
 		 274 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  63.71 
 
 		 292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  61.78 
 
 		 278 aa  334  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  61.78 
 
 		 278 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  61.78 
 
 		 278 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  59.47 
 
 		 268 aa  324  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  61.39 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  57.09 
 
 		 294 aa  312  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  60.23 
 
 		 305 aa  311  7.999999999999999e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  57.66 
 
 		 296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  53.93 
 
 		 306 aa  292  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  57.09 
 
 		 285 aa  288  8e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  54.02 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  51.35 
 
 		 299 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  51.01 
 
 		 311 aa  252  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  49.83 
 
 		 292 aa  251  9.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  51.13 
 
 		 293 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  52.09 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.26 
 
 		 309 aa  242  7e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  52.26 
 
 		 290 aa  242  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  48.56 
 
 		 291 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  52.51 
 
 		 276 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  50.38 
 
 		 287 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  54 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  51.6 
 
 		 303 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  47.77 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  48.3 
 
 		 282 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  47.83 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  48.34 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  46.56 
 
 		 298 aa  223  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  51.89 
 
 		 294 aa  223  4e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  47.88 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  44.13 
 
 		 280 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.22 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  45.63 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  46.64 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  47.58 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  44.91 
 
 		 299 aa  215  9e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  44.56 
 
 		 292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  45.38 
 
 		 288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  45.63 
 
 		 274 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  47.91 
 
 		 296 aa  210  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  44.02 
 
 		 268 aa  208  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  44.32 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  44.4 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  45.42 
 
 		 309 aa  195  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  46.51 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  42.81 
 
 		 281 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.4 
 
 		 314 aa  191  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  39.39 
 
 		 366 aa  191  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  45.56 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  45.56 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  45.56 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  44.53 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  44.74 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  44.96 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  44.76 
 
 		 311 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  44.96 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  42.81 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  44.57 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  44.57 
 
 		 312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  44.19 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  44.19 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  44.19 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  44.57 
 
 		 797 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  41.76 
 
 		 277 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  38.46 
 
 		 250 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  36.58 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  36.02 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  34.81 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  35.52 
 
 		 251 aa  138  8.999999999999999e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  34.24 
 
 		 231 aa  138  1e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  31.63 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  34.78 
 
 		 264 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  32.23 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  35.93 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  33.85 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  32.6 
 
 		 251 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  35.82 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  34.18 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  35.94 
 
 		 256 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  34.07 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  36.33 
 
 		 254 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.85 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 251 aa  127  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  36 
 
 		 252 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  30.77 
 
 		 247 aa  126  5e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  32.68 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  33.7 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  33.88 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2682  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 271 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  34.34 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  34.44 
 
 		 256 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  30.83 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  34.2 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  37.02 
 
 		 251 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>