More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3792 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 299 aa  600  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  58.33 
 
 		 294 aa  312  3.9999999999999997e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  58.33 
 
 		 268 aa  312  4.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  59.3 
 
 		 305 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  57.14 
 
 		 292 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  56.65 
 
 		 278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  58.97 
 
 		 296 aa  305  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  56.65 
 
 		 278 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  56.65 
 
 		 278 aa  305  6e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  56.83 
 
 		 280 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  62.16 
 
 		 276 aa  302  5.000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  57.35 
 
 		 306 aa  295  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  57.3 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  56.54 
 
 		 311 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  58.4 
 
 		 285 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  60 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  54.68 
 
 		 274 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  53.05 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  51.35 
 
 		 296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  56.44 
 
 		 293 aa  269  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  54.78 
 
 		 315 aa  263  3e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  50.99 
 
 		 297 aa  261  8e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  53.73 
 
 		 279 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  56.63 
 
 		 290 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  56 
 
 		 339 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  54.47 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  56.52 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  52.59 
 
 		 291 aa  252  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  52.53 
 
 		 293 aa  249  5e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  54.8 
 
 		 303 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  53.33 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  52.09 
 
 		 287 aa  246  4e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  50.77 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  53.1 
 
 		 292 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  53.28 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  48.08 
 
 		 325 aa  235  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  49.42 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  44.9 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  48.25 
 
 		 294 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  54.34 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  49.43 
 
 		 288 aa  226  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  51 
 
 		 295 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  44.83 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  46.98 
 
 		 296 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  50.61 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  48.08 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  50.19 
 
 		 309 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  49.43 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  49.81 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  49.04 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  49.04 
 
 		 362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  49.04 
 
 		 362 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  49.04 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  47.42 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 310 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  49.61 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  49.61 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  49.61 
 
 		 312 aa  212  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 797 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  45.9 
 
 		 314 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  41.78 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  48.22 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  43.61 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  43.26 
 
 		 282 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  44.32 
 
 		 281 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  43.4 
 
 		 281 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  32.6 
 
 		 406 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  36.03 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  38.58 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.8 
 
 		 252 aa  135  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  33.1 
 
 		 346 aa  133  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  35.38 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  32 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  32 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  37.14 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  35.74 
 
 		 266 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  35.34 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  39.32 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  37.25 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  35.44 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  34.15 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  36.12 
 
 		 236 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  34.84 
 
 		 242 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  36 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  34.34 
 
 		 242 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  36.21 
 
 		 231 aa  122  9.999999999999999e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  33.07 
 
 		 242 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  31.71 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  32.16 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  36.36 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  31.73 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  35.71 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  33.06 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  34.06 
 
 		 256 aa  118  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  31.64 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  29.3 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  33.75 
 
 		 252 aa  116  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  33.19 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>