More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2025 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  66.54 
 
 		 294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  65.77 
 
 		 294 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  62.93 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  60.77 
 
 		 293 aa  318  7e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  66.02 
 
 		 309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  54.12 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  58.3 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  57.36 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  53.38 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  57.2 
 
 		 362 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  57.2 
 
 		 304 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  57.2 
 
 		 362 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  55.56 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  55.04 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  54.83 
 
 		 274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  53.76 
 
 		 345 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  55.71 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  53.09 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  56.23 
 
 		 296 aa  268  8.999999999999999e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  53.09 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  50.37 
 
 		 298 aa  262  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  52.94 
 
 		 311 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  50.94 
 
 		 277 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  53.18 
 
 		 310 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  53.18 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  51.32 
 
 		 292 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  52.81 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  52.81 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  50.98 
 
 		 280 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  52.81 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  53.61 
 
 		 797 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  48.66 
 
 		 292 aa  245  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.61 
 
 		 309 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  50.19 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  51.97 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  49.81 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  49.81 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  49.06 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  49.25 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  47.48 
 
 		 311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  46 
 
 		 306 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  48.65 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  49.43 
 
 		 299 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  46.72 
 
 		 287 aa  224  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  50.6 
 
 		 290 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  49.59 
 
 		 303 aa  222  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  46.85 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  52.19 
 
 		 294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  49.81 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  49.19 
 
 		 290 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  50.57 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  48.82 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.15 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  46.95 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  43.9 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  45.53 
 
 		 297 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  44.91 
 
 		 296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.24 
 
 		 339 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  48.02 
 
 		 315 aa  209  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  45.42 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  44.03 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  47.22 
 
 		 279 aa  202  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  47.84 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  38.14 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  42.91 
 
 		 325 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  43.68 
 
 		 314 aa  183  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  32.53 
 
 		 406 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  33.7 
 
 		 346 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  31.18 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  31.18 
 
 		 244 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  31.09 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.3 
 
 		 252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  27.9 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  34.65 
 
 		 253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  27.44 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  31.8 
 
 		 231 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  33.03 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  33.95 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  34.22 
 
 		 251 aa  123  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  30.65 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  33.33 
 
 		 257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  37.23 
 
 		 236 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  31.85 
 
 		 253 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  32.84 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  36.7 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  30.24 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  32.05 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  33.6 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  31.56 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  35.15 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  29.57 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  28.57 
 
 		 245 aa  117  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  36.48 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  34.51 
 
 		 254 aa  115  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  35.04 
 
 		 250 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  27.92 
 
 		 264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  29.91 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  33.61 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  31.56 
 
 		 248 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>