More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2379 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  99.68 
 
 
797 aa  630  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 
310 aa  623  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  97.12 
 
 
312 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  97.12 
 
 
312 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  97.76 
 
 
312 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  97.12 
 
 
312 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  89.39 
 
 
311 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  83.27 
 
 
345 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  82.18 
 
 
362 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  82.18 
 
 
362 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  82.18 
 
 
304 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  82.18 
 
 
298 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  81.82 
 
 
298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  80.9 
 
 
338 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  71.58 
 
 
292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  72.28 
 
 
303 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  71.58 
 
 
295 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  65.43 
 
 
274 aa  352  5e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  62.59 
 
 
277 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  59.7 
 
 
293 aa  301  9e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  58.27 
 
 
294 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  58.27 
 
 
294 aa  292  5e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  54.29 
 
 
299 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  56.82 
 
 
308 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  48.54 
 
 
298 aa  268  8.999999999999999e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  53.85 
 
 
280 aa  266  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  54.37 
 
 
268 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  56.93 
 
 
296 aa  265  7e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  56.02 
 
 
309 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  54.55 
 
 
288 aa  257  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  54.62 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  53.26 
 
 
282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  52.96 
 
 
281 aa  238  9e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  44.48 
 
 
311 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.02 
 
 
309 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  50.58 
 
 
281 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  46.91 
 
 
297 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  44.3 
 
 
292 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 
299 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  48.85 
 
 
287 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  48.33 
 
 
292 aa  221  9e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.92 
 
 
325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  47.69 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  47.53 
 
 
306 aa  215  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  49.41 
 
 
315 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  46.74 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  46.77 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  46.77 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  46.77 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  47.04 
 
 
293 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  47.66 
 
 
282 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  46.77 
 
 
279 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  39.17 
 
 
366 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  45.16 
 
 
294 aa  205  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  48.66 
 
 
276 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  45.17 
 
 
314 aa  202  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  47.25 
 
 
339 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  47.18 
 
 
305 aa  201  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  44.57 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  48.82 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  45 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  44.85 
 
 
285 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  46.12 
 
 
303 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  44.32 
 
 
274 aa  192  8e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  45.56 
 
 
290 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  44.78 
 
 
296 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.728711 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  35.11 
 
 
406 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  34.93 
 
 
266 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  32.36 
 
 
346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  30.88 
 
 
252 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  31.97 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  35 
 
 
253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  35.71 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  35.71 
 
 
244 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  34.68 
 
 
256 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  35.97 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  35.02 
 
 
249 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  34.83 
 
 
253 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  35.08 
 
 
257 aa  132  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  31.23 
 
 
253 aa  132  9e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  32.39 
 
 
251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  31.35 
 
 
253 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  30.77 
 
 
243 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  31.76 
 
 
253 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  35.93 
 
 
259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  33.84 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  33.73 
 
 
253 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  33.48 
 
 
256 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  33.45 
 
 
248 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  31.25 
 
 
231 aa  125  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  31.64 
 
 
253 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  33.46 
 
 
248 aa  125  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  32.71 
 
 
251 aa  125  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  33.22 
 
 
251 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  36.4 
 
 
259 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  28.67 
 
 
245 aa  123  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  30.8 
 
 
245 aa  123  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  34.23 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  37.67 
 
 
246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>