More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2622 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  86.79 
 
 		 281 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  69.06 
 
 		 280 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  58.03 
 
 		 282 aa  305  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  51.34 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  50.56 
 
 		 268 aa  261  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  49.28 
 
 		 292 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  51.63 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 311 aa  248  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  50.59 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  50.39 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  53.28 
 
 		 296 aa  245  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  48.05 
 
 		 294 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  46.69 
 
 		 274 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  48.65 
 
 		 288 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  49.42 
 
 		 362 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  49.42 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  49.42 
 
 		 362 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  47.97 
 
 		 298 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  47.97 
 
 		 345 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  50.97 
 
 		 797 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  50.58 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  50.58 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  50.19 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  49.42 
 
 		 338 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  47.23 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  50.19 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  50.19 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  45.16 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  43.87 
 
 		 293 aa  228  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  46.89 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  49.03 
 
 		 309 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  44.62 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  48.63 
 
 		 308 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  45.74 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  44.96 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  45.11 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  46.36 
 
 		 292 aa  222  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  43.45 
 
 		 280 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  42.75 
 
 		 297 aa  218  6e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.88 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  42.91 
 
 		 292 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  41.58 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  42.45 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  44.98 
 
 		 303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  44.32 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  41.95 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  48.4 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  41.95 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  41.95 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  47.55 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  42.35 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  44.11 
 
 		 339 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  45.16 
 
 		 290 aa  208  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  45.52 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  42.18 
 
 		 268 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  42.34 
 
 		 294 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  43.23 
 
 		 296 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  42 
 
 		 299 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  39.69 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  44 
 
 		 285 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  42.19 
 
 		 305 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  39.72 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  41.52 
 
 		 296 aa  196  5.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  42.45 
 
 		 314 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  45.42 
 
 		 294 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  38.85 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  31.17 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  36.22 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  29.6 
 
 		 234 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  30.22 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  33.07 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  29.84 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  29.84 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  34.78 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  34.35 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  35.36 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  34.36 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  30.62 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  32.54 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.83 
 
 		 245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  33.08 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  32.96 
 
 		 254 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  31.65 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  31.03 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  29.78 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  31.7 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  35.32 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  31.78 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  28.4 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.32 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  31.54 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  30.24 
 
 		 253 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  30.32 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  34.1 
 
 		 249 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  32.22 
 
 		 241 aa  112  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  31.23 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  31.72 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  29.88 
 
 		 237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  28.21 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>