More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0210 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  75.77 
 
 		 293 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  66.15 
 
 		 294 aa  335  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  64.66 
 
 		 294 aa  334  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  65.66 
 
 		 308 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  64.54 
 
 		 288 aa  320  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  67.73 
 
 		 309 aa  302  3.0000000000000004e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  58.37 
 
 		 295 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  56.62 
 
 		 292 aa  291  7e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  58.37 
 
 		 303 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  56.98 
 
 		 299 aa  285  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  55.77 
 
 		 274 aa  278  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  53.49 
 
 		 298 aa  278  8e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  57.14 
 
 		 345 aa  277  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  56.37 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  56.54 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  56.54 
 
 		 362 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  56.54 
 
 		 362 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  56.37 
 
 		 298 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  55.6 
 
 		 298 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  52.83 
 
 		 277 aa  264  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  56.37 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  54.47 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  55.98 
 
 		 296 aa  254  8e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  50.76 
 
 		 292 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  50.56 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  54.37 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  54.37 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  53.99 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  53.99 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  53.99 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  54.37 
 
 		 797 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  53.33 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  50.56 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  52.76 
 
 		 290 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  52.97 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  51.6 
 
 		 282 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  51.17 
 
 		 306 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  52.42 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 292 aa  231  9e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  50.19 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  50.59 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  53.15 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  48.83 
 
 		 280 aa  229  5e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  52.87 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  53.65 
 
 		 315 aa  225  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  50.99 
 
 		 306 aa  221  7e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  48.48 
 
 		 279 aa  221  8e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  51.23 
 
 		 339 aa  221  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  47.29 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  48.77 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  50.42 
 
 		 293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  47.29 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  47.29 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  51.33 
 
 		 303 aa  217  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  49.15 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  50.63 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  47.62 
 
 		 305 aa  215  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.02 
 
 		 325 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  49.56 
 
 		 290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  45.59 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  49.4 
 
 		 296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  49.61 
 
 		 285 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  44.02 
 
 		 296 aa  208  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  42.31 
 
 		 366 aa  206  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  45.25 
 
 		 314 aa  187  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  33 
 
 		 406 aa  162  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  30.71 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  30.71 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  36.32 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  30.65 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  135  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  34.95 
 
 		 346 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  31.82 
 
 		 253 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  35.66 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  31.06 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  35.46 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  31.58 
 
 		 256 aa  132  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  32.05 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  33.08 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  34.85 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  33.89 
 
 		 251 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  31.99 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  31.06 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  32.61 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  36.33 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  30.68 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  36.18 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  33.05 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  35.14 
 
 		 254 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  31.06 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  37.61 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  36.84 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  32.75 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  32.92 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  37.44 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  34.81 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  35.54 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  31.8 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>