More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2495 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2495  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 282 aa  552  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.479866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2791  silent information regulator protein Sir2  70.11 
 
 		 315 aa  379  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0866  Silent information regulator protein Sir2  62.78 
 
 		 297 aa  319  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8749  silent information regulator protein Sir2  62.08 
 
 		 293 aa  315  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4322  Silent information regulator protein Sir2  61.42 
 
 		 279 aa  306  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0651749  normal  0.0646385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8513  Silent information regulator protein Sir2  60.21 
 
 		 311 aa  305  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2516  silent information regulator protein Sir2  64.82 
 
 		 290 aa  302  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.201508  hitchhiker  0.00304411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2378  silent information regulator protein Sir2  64.03 
 
 		 303 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0217965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1962  Silent information regulator protein Sir2  58.55 
 
 		 292 aa  292  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000762796  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0509  Silent information regulator protein Sir2  63.97 
 
 		 294 aa  291  9e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.529427  normal  0.390034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14160  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  58.62 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1523  Silent information regulator protein Sir2  59.25 
 
 		 290 aa  270  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  56.09 
 
 		 292 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  54.32 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  53.9 
 
 		 278 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  54.44 
 
 		 268 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  53.9 
 
 		 278 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  53.9 
 
 		 278 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18630  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  55.22 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0409224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2641  silent information regulator protein Sir2  55.11 
 
 		 280 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1653  Silent information regulator protein Sir2  54.48 
 
 		 291 aa  262  4e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.24521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1150  Silent information regulator protein Sir2  56.23 
 
 		 285 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.728431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3792  Silent information regulator protein Sir2  53.31 
 
 		 299 aa  258  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.56379  normal  0.48751 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0217  Silent information regulator protein Sir2  54.26 
 
 		 305 aa  258  9e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0528  Silent information regulator protein Sir2  54.58 
 
 		 294 aa  254  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.02282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2200  Silent information regulator protein Sir2  51.09 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000778097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2461  silent information regulator protein Sir2  50.18 
 
 		 306 aa  244  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0500585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0781  silent information regulator protein Sir2  57.36 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0484  Silent information regulator protein Sir2  50.89 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.728711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1482  Silent information regulator protein Sir2  53.01 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0265  silent information regulator protein Sir2  50.98 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17240  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  49.82 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0983545 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2063  Silent information regulator protein Sir2  48.31 
 
 		 296 aa  231  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1690  Silent information regulator protein Sir2  49.03 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1839  silent information regulator protein Sir2  49.42 
 
 		 294 aa  226  4e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.056471  normal  0.640257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0749  silent information regulator protein Sir2  49.62 
 
 		 296 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2025  silent information regulator protein Sir2  48.66 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03769  NAD-dependent deacetylase  49.21 
 
 		 293 aa  221  9e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5921  NAD-dependent deacetylase  46.33 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  50.63 
 
 		 268 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  47.88 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4712  silent information regulator protein Sir2  47.81 
 
 		 295 aa  215  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  0.0150629 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5976  Silent information regulator protein Sir2  46.74 
 
 		 292 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.715306  normal  0.828791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3235  silent information regulator protein Sir2  50.76 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.429904  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0629  NAD-dependent deacetylase  49.41 
 
 		 311 aa  214  9e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.289592  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29750  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  50.19 
 
 		 339 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2078  silent information regulator protein Sir2  45.65 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.538647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2213  silent information regulator protein Sir2  46.99 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3622  NAD-dependent deacetylase  48.29 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4461  NAD-dependent deacetylase  48.29 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3905  NAD-dependent deacetylase  48.29 
 
 		 362 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21543  predicted protein  41.43 
 
 		 366 aa  203  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  46.39 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2183  NAD-dependent deacetylase  47.15 
 
 		 345 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5254  NAD-dependent deacetylase  44.44 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22600  Silent information regulator protein, Sir 2  44.32 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2518  NAD-dependent deacetylase  47.53 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  46.01 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0418  NAD-dependent deacetylase  47.15 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2379  NAD-dependent deacetylase  47.53 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0466  NAD-dependent deacetylase  47.15 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2880  silent information regulator protein Sir2  42.19 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1796  NAD-dependent deacetylase  47.15 
 
 		 312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0830  NAD-dependent deacetylase  47.53 
 
 		 797 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2622  transcriptional regulator, Sir2 family  45.82 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0160529  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4678  NAD-dependent deacetylase  45.98 
 
 		 338 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2362  silent information regulator protein Sir2  45.65 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.640546  normal  0.357121 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11067  Silencing information regulator [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q71SB1]  34.46 
 
 		 406 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000622843  normal  0.496753 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.62 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03970  conserved hypothetical protein  36.47 
 
 		 346 aa  143  3e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  35.14 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  31.16 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  38.29 
 
 		 254 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  34.35 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  35.4 
 
 		 269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  34.73 
 
 		 231 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  38.06 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  33.21 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  32.13 
 
 		 256 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  37.5 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  34.66 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  33.7 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  31.6 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  35.79 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  35.56 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  31.02 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  33.71 
 
 		 259 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  31.97 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  36.06 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  32.12 
 
 		 253 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  37.45 
 
 		 256 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  31.91 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  29.05 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  32.34 
 
 		 253 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  32.26 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  32.26 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  29.18 
 
 		 246 aa  122  8e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  34.15 
 
 		 248 aa  122  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>