More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0067 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  61.83 
 
 		 244 aa  323  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  63.33 
 
 		 243 aa  317  9e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  61.67 
 
 		 245 aa  305  5.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  58.26 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  56.43 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  58.16 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  55 
 
 		 246 aa  275  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  41.37 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  43.75 
 
 		 246 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  43.33 
 
 		 243 aa  214  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  43.33 
 
 		 243 aa  214  8e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  43.03 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  44.86 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  44.49 
 
 		 244 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  40.76 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  44.44 
 
 		 231 aa  175  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  41.67 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  40.82 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  41.84 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  41.84 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  38.66 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  40.09 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  41.99 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  41.84 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  39.91 
 
 		 246 aa  164  9e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  38.33 
 
 		 241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 		 245 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  36.59 
 
 		 253 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  39.74 
 
 		 242 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  38.75 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  39.33 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  41 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  38.08 
 
 		 242 aa  161  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  38.75 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  38.49 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  36.59 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  37.04 
 
 		 264 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  37.71 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  38.15 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  36.96 
 
 		 259 aa  158  9e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  37.34 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2529  silent information regulator protein Sir2  35.6 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.899419 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2792  silent information regulator protein Sir2  35.37 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.867535  normal  0.628566 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2939  silent information regulator protein Sir2  35.6 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  34.88 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  39.91 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0208  NAD-dependent deacetylase  38.32 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  37.82 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  38.56 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  36.71 
 
 		 251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  35.8 
 
 		 260 aa  151  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  34.98 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  38.33 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  39.18 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  37.71 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  38.06 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  38.56 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  38.32 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  37.87 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  36.99 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  36.93 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  37.76 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1553  silent information regulator protein Sir2  37.97 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.469137  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  39.17 
 
 		 254 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  40.17 
 
 		 243 aa  145  8.000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4037  putative transciptional regulatory Sir2-family protein  36.63 
 
 		 253 aa  144  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.185162 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  34.85 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  35.68 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2137  Silent information regulator protein Sir2  36.17 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268071  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  36.51 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  34.55 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  34.89 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  35.54 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  35.39 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  35.56 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  38.33 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  36.7 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0091  NAD-dependent deacetylase  35.19 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0206655 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  33.61 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  36.99 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1797  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  39.52 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  39.15 
 
 		 246 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1331  transcriptional regulator, Sir2 family  34.9 
 
 		 257 aa  134  9e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  36.93 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  34.62 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  35.22 
 
 		 241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  38.12 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  33.75 
 
 		 245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  33.47 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0501  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 308 aa  133  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.330366 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  35.34 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  34.18 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>