More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0208 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0208  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 232 aa  484  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0091  NAD-dependent deacetylase  47.62 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0206655 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0337  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  48.93 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00956339  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1797  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  48.25 
 
 		 233 aa  211  9e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  41.28 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  39.57 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  39.57 
 
 		 243 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  43.41 
 
 		 245 aa  164  8e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  40.38 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  40.38 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  38.32 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  40.41 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  41.09 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  36.29 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  38.86 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  37.87 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  37.87 
 
 		 245 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  37.87 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  38.12 
 
 		 241 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  37.45 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  37.45 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  37.45 
 
 		 242 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  37.45 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  37.02 
 
 		 241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  37.76 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  37.45 
 
 		 245 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  37.16 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  37.16 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  38.5 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  35.94 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  34.62 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  30.67 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  37.81 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  30.71 
 
 		 283 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  33.77 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  33.65 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  31.76 
 
 		 249 aa  118  6e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  35.27 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  33.88 
 
 		 245 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  33.83 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  38.67 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  35.06 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  33.99 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  30.53 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 251 aa  115  7.999999999999999e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  35.21 
 
 		 244 aa  114  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  33.98 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  36.27 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  37.44 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  35.42 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  31.86 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  33.18 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  33.01 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  37.57 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  31.47 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  34.16 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  35.1 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  33.01 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  34.98 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  32.76 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  33.82 
 
 		 245 aa  112  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  35.96 
 
 		 256 aa  112  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  34.06 
 
 		 233 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  31.25 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  37.77 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  33.03 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  32.39 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  33.97 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  33.82 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  35.78 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  32.99 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0371  silent information regulator protein Sir2  34.8 
 
 		 226 aa  108  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  31.25 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  35.64 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  34.9 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  36.27 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  30.91 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  30.3 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  28.63 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  37.23 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  37.75 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  29.65 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  32.64 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  37.23 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  32.2 
 
 		 261 aa  105  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  32.72 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  30.48 
 
 		 265 aa  105  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  35.23 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  33.99 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  32.23 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  34 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  34 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  34 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  34 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  34 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  35.98 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  32.18 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  31.16 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  31.98 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>