More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4319 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4319  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 131 aa  271  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  64.06 
 
 		 252 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  61.94 
 
 		 262 aa  174  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 262 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  64.46 
 
 		 256 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  71.29 
 
 		 230 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  59.66 
 
 		 250 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  55.93 
 
 		 258 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  56.67 
 
 		 250 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  52.14 
 
 		 243 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  49.23 
 
 		 249 aa  133  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 255 aa  126  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  50.89 
 
 		 246 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  49.58 
 
 		 248 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  52.8 
 
 		 264 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 249 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  51.28 
 
 		 248 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  49.12 
 
 		 247 aa  123  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  49.11 
 
 		 249 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  48.76 
 
 		 260 aa  121  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  47.93 
 
 		 269 aa  120  7e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 244 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  48.15 
 
 		 233 aa  119  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  52.73 
 
 		 242 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  46.88 
 
 		 266 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  46.9 
 
 		 258 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  48.74 
 
 		 251 aa  118  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  48.28 
 
 		 244 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  50.43 
 
 		 273 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  50.42 
 
 		 251 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  46.77 
 
 		 249 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  52.83 
 
 		 237 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  51.4 
 
 		 237 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  51.4 
 
 		 237 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  51.4 
 
 		 237 aa  116  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  51.89 
 
 		 236 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  51.89 
 
 		 236 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  46.73 
 
 		 241 aa  114  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  46.15 
 
 		 246 aa  113  7.999999999999999e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  47.79 
 
 		 260 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  47.79 
 
 		 260 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  47.97 
 
 		 306 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  53.77 
 
 		 230 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  43.09 
 
 		 233 aa  110  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  45.61 
 
 		 256 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  45.3 
 
 		 249 aa  110  8.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  46.77 
 
 		 242 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  44.17 
 
 		 259 aa  109  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  49.11 
 
 		 237 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  47.32 
 
 		 229 aa  107  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  45.61 
 
 		 244 aa  107  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  50.47 
 
 		 230 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0531  Silent information regulator protein Sir2  51.85 
 
 		 227 aa  107  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000137862 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  43.48 
 
 		 284 aa  105  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  49.11 
 
 		 239 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  45.3 
 
 		 229 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  46.72 
 
 		 245 aa  104  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  45 
 
 		 245 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  44.07 
 
 		 259 aa  103  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  43.48 
 
 		 234 aa  103  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  47.71 
 
 		 233 aa  103  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  43.8 
 
 		 235 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  43.93 
 
 		 251 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  50.45 
 
 		 242 aa  101  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  46.85 
 
 		 243 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  43.09 
 
 		 245 aa  101  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1071  NAD-dependent deacetylase  47.66 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.202923  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1194  NAD-dependent deacetylase  47.66 
 
 		 233 aa  100  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0597441  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  47.66 
 
 		 226 aa  100  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  48.15 
 
 		 225 aa  100  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  46.43 
 
 		 241 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  49.53 
 
 		 232 aa  99.8  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  45.87 
 
 		 230 aa  99.4  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  40.98 
 
 		 247 aa  99  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0264  Silent information regulator protein Sir2  48.25 
 
 		 246 aa  99.4  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  48.62 
 
 		 230 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  43.75 
 
 		 256 aa  98.6  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  45.83 
 
 		 278 aa  98.2  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  45.83 
 
 		 278 aa  98.2  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 		 237 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  48.15 
 
 		 232 aa  97.8  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  41.27 
 
 		 243 aa  97.4  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  42.06 
 
 		 239 aa  97.1  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  46.9 
 
 		 276 aa  96.7  9e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  42.86 
 
 		 256 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  45 
 
 		 278 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  41.67 
 
 		 248 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  44.25 
 
 		 273 aa  95.9  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  43.1 
 
 		 257 aa  95.5  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  46.85 
 
 		 237 aa  95.5  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  43.36 
 
 		 273 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  42.61 
 
 		 273 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  42.61 
 
 		 273 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1487  Silent information regulator protein Sir2  45.45 
 
 		 230 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.72672  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  42.61 
 
 		 273 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  42.61 
 
 		 273 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  42.61 
 
 		 273 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  45.87 
 
 		 259 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  46.02 
 
 		 276 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  44.86 
 
 		 254 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>