More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32025 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32025  putative histone deacetylase-like protein  100 
 
 		 326 aa  667    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.822239  normal  0.176883 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07461  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05900)  47.88 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.12277 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04320  NAD-dependent histone deacetylase, putative  42.06 
 
 		 413 aa  245  8e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16771  predicted protein  41.41 
 
 		 329 aa  228  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0241463 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16859  predicted protein  45.17 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08450  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00520)  38 
 
 		 2081 aa  197  3e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.601211 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40594  NAD-dependent histone deacetylase SIR2 (Regulatory protein SIR2) (Silent information regulator 2)  39.46 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.326026 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10449  histone deacetylase (Eurofung)  35.1 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.882233 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02940  histone deacetylase, putative  32.26 
 
 		 596 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_2658  NAD-dependent histone deacetylase  35.51 
 
 		 425 aa  161  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.755641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  35.63 
 
 		 256 aa  143  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  38.77 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 		 244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 		 244 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8827  predicted protein  37.26 
 
 		 219 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45850  silent information regulator protein Sir2  34.95 
 
 		 328 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2277  Sir2 family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.256222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0627  silent information regulator protein Sir2  35.38 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.208993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0631  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  36.28 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  32.66 
 
 		 243 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12305  predicted protein  34.31 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  33.78 
 
 		 250 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  30.68 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  33.62 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0390  Silent information regulator protein Sir2  37.09 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 241 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0747  silent information regulator protein Sir2  36.79 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00199209  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0957  silent information regulator protein Sir2  36 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.925274  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26850  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  35.78 
 
 		 245 aa  118  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  33.65 
 
 		 256 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  29.13 
 
 		 248 aa  116  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  32.75 
 
 		 241 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  32.31 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  30.48 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  32.74 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  32.94 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  32.31 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  34.71 
 
 		 231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  32.31 
 
 		 242 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  32.61 
 
 		 241 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  34.23 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  33.64 
 
 		 253 aa  114  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  32.17 
 
 		 245 aa  113  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1033  Sir2 family regulatory protein  32.9 
 
 		 253 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  33.91 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  31.25 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  31.74 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  31.88 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  31.74 
 
 		 245 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  32.6 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2158  Silent information regulator protein Sir2  35.32 
 
 		 237 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.647526  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  30.73 
 
 		 252 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  31.39 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  32.13 
 
 		 257 aa  110  5e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  30.34 
 
 		 266 aa  109  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  34.72 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  30 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  33.47 
 
 		 244 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  31.03 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2952  silent information regulator protein Sir2  29.74 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521347 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  32.67 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  33.33 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1499  NAD-dependent protein deacetylase  32.86 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  31.96 
 
 		 236 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  34.33 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  31.56 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  31.34 
 
 		 256 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  33.02 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1913  silent information regulator protein Sir2  32.35 
 
 		 234 aa  103  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  31.28 
 
 		 249 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  32.41 
 
 		 248 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1781  NAD-dependent deacetylase  31.76 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  28.38 
 
 		 259 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0098  silent information regulator protein Sir2  29.56 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2800  Silent information regulator protein Sir2  29.41 
 
 		 253 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  31.78 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  30.56 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0295  Silent information regulator protein Sir2  30.16 
 
 		 283 aa  100  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.216345 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04510  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.28 
 
 		 268 aa  99.8  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.542258  normal  0.143323 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  29.02 
 
 		 242 aa  99.8  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2614  Silent information regulator protein Sir2  28.24 
 
 		 248 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.727744  normal  0.849017 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  28.9 
 
 		 259 aa  99.4  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  30.09 
 
 		 252 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4173  silent information regulator protein Sir2  30.59 
 
 		 256 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  31.06 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  31.84 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  29.96 
 
 		 249 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  30.74 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  30.74 
 
 		 243 aa  98.2  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  30.93 
 
 		 264 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  30.41 
 
 		 246 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3550  silent information regulator protein Sir2  28.95 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0552  Silent information regulator protein Sir2  31.65 
 
 		 251 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3545  silent information regulator protein Sir2  28.95 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3618  silent information regulator protein Sir2  28.95 
 
 		 278 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.688367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  27.27 
 
 		 242 aa  97.1  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  30 
 
 		 249 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  31.31 
 
 		 269 aa  96.3  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2468  Silent information regulator protein Sir2  30.77 
 
 		 287 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3942  silent information regulator protein Sir2  28.45 
 
 		 292 aa  95.9  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.288967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>