More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5036 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 295 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  52.82 
 
 		 279 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  52.46 
 
 		 279 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  51.41 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  50.35 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  37.5 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  39.64 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  37.59 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  38.02 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  36.86 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  37.94 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  40.33 
 
 		 247 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  35.82 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  39.02 
 
 		 233 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  37.21 
 
 		 245 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  37.28 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  34.93 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  36.12 
 
 		 244 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  36.9 
 
 		 265 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  34.05 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  34.47 
 
 		 249 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  34.47 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  34.72 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  37.76 
 
 		 243 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  37.83 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  36.43 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  34.84 
 
 		 276 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  35.45 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  36.33 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  34.56 
 
 		 273 aa  123  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  34.56 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  34.56 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  34.56 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  34.56 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  35.38 
 
 		 244 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  34.56 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  34.56 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  34.56 
 
 		 273 aa  122  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  36.67 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  34.86 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1963  NAD-dependent deacetylase  34.86 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.696827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1298  NAD-dependent deacetylase  34.86 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2147  NAD-dependent deacetylase  34.86 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.180937  hitchhiker  0.00193472 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1336  NAD-dependent deacetylase  34.86 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0564369 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1321  NAD-dependent deacetylase  34.86 
 
 		 273 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0350313  hitchhiker  0.00447864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  39.48 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  35.36 
 
 		 248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  33.93 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  34.8 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  34.09 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  38.03 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  32.75 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  35.07 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  36.81 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  34.56 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  35.02 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  36.17 
 
 		 243 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  32.14 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.95 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  31.67 
 
 		 242 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  35.13 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  33.21 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  33.21 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  33.58 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  32.96 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  37.12 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  32.85 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  34.56 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  33.21 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  31.41 
 
 		 320 aa  113  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  32.82 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  32.08 
 
 		 235 aa  112  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  31.88 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  33.57 
 
 		 278 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  34.94 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1435  NAD-dependent deacetylase  34.18 
 
 		 248 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000823864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  34.94 
 
 		 236 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  35.15 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  32.59 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  32.95 
 
 		 259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  33.33 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  30.6 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  31.5 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  35.44 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  34.94 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  33.59 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  32.39 
 
 		 297 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  34.03 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  33.09 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  31.43 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  33.46 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  30.71 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  32.71 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  32.71 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  32.71 
 
 		 237 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  34.69 
 
 		 237 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  34.69 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>