More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4046 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  92.98 
 
 		 288 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  93.73 
 
 		 289 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  93.73 
 
 		 289 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  86.05 
 
 		 297 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  88.97 
 
 		 290 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  89.26 
 
 		 273 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  75.27 
 
 		 343 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  75.46 
 
 		 343 aa  417  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  75.09 
 
 		 450 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  75.09 
 
 		 351 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  75.09 
 
 		 416 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  75.09 
 
 		 416 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  75.09 
 
 		 416 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  75.37 
 
 		 416 aa  410  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  57.09 
 
 		 282 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  61.79 
 
 		 255 aa  310  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  55.68 
 
 		 273 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  55.97 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  55.88 
 
 		 285 aa  287  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  57.2 
 
 		 269 aa  285  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  57.74 
 
 		 271 aa  275  4e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  52.96 
 
 		 278 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  48.15 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  53.51 
 
 		 279 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  53.38 
 
 		 275 aa  266  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  53.99 
 
 		 273 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  50.74 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  50.74 
 
 		 274 aa  254  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  51.71 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  55.04 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  52.11 
 
 		 289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  50.75 
 
 		 277 aa  242  5e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  50.38 
 
 		 280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  41.95 
 
 		 275 aa  229  5e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  45.59 
 
 		 272 aa  228  8e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  51.42 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  42.91 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  31.95 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  30.68 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  29.89 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  29.97 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.7 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  29.14 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  30 
 
 		 295 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  34.86 
 
 		 244 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  31.78 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  31.32 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  31.46 
 
 		 244 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  31.3 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  32.64 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  31.08 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  35.8 
 
 		 244 aa  93.2  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  33.7 
 
 		 256 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  29.73 
 
 		 284 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  28.3 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  28.69 
 
 		 249 aa  89.4  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  34.55 
 
 		 248 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  30.43 
 
 		 254 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  29.79 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  30.32 
 
 		 242 aa  86.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  29.23 
 
 		 252 aa  86.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  32.97 
 
 		 247 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  23.18 
 
 		 287 aa  85.9  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  29.24 
 
 		 612 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  30.18 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  29.62 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  35.14 
 
 		 251 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  33.19 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  34.66 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  30.04 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  32 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  29.1 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  34.33 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  24.9 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  32.35 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  29.91 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  27.78 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  28.06 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  25.65 
 
 		 247 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  28.8 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00950  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  28.99 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0748135  normal  0.482885 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  28.8 
 
 		 237 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  34.64 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  25 
 
 		 583 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  30.49 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  29.28 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  31.85 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  28.26 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  29.76 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  28.94 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  29.87 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  32.96 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  32.96 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  29.82 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  33.53 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  30 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  30.77 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  29.61 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>