More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2765 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 
285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  73.17 
 
 
269 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  59.13 
 
 
255 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  59.84 
 
 
271 aa  296  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  56.46 
 
 
297 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  54.78 
 
 
282 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  51.09 
 
 
273 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  56.87 
 
 
290 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  56.09 
 
 
288 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  55.27 
 
 
343 aa  288  6e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  54.24 
 
 
416 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  54.24 
 
 
416 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  54.24 
 
 
416 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  54.24 
 
 
450 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  54.24 
 
 
351 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  56.09 
 
 
289 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  56.09 
 
 
273 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  56.09 
 
 
289 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  59.36 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  53.28 
 
 
416 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  48.9 
 
 
274 aa  278  6e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  58 
 
 
290 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  52.77 
 
 
343 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  54.89 
 
 
273 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  50.55 
 
 
280 aa  261  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  52.4 
 
 
280 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  54.03 
 
 
277 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  47.13 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  50.18 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  54.68 
 
 
256 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  49.81 
 
 
272 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  52.48 
 
 
279 aa  247  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  52.47 
 
 
289 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  46.35 
 
 
275 aa  238  9e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  46.89 
 
 
274 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  45.15 
 
 
350 aa  235  8e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  44.44 
 
 
272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  43.68 
 
 
275 aa  230  2e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  31.92 
 
 
246 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  27.72 
 
 
245 aa  107  3e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  29.89 
 
 
244 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  34.25 
 
 
306 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  32.14 
 
 
248 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  26.88 
 
 
266 aa  99.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.06 
 
 
251 aa  99.4  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  30.04 
 
 
269 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  26.79 
 
 
242 aa  96.3  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  28.31 
 
 
251 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  29.34 
 
 
257 aa  93.6  4e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  30.85 
 
 
295 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  29.68 
 
 
287 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  33.52 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  33.52 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  33.52 
 
 
237 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  34.43 
 
 
236 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.62 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  32.11 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  34.07 
 
 
236 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  28.1 
 
 
249 aa  90.1  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  33.92 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  32.95 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  27.57 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 
279 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  27.08 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  29.86 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  31.84 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  26.59 
 
 
245 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  30.89 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235336 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  27.65 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  28.29 
 
 
245 aa  84  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  27.82 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  26.49 
 
 
244 aa  82.8  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  26.98 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  31.92 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  26.56 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 
612 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  27.11 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  30.15 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  26.47 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  33.15 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  27.75 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  31.69 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  30.28 
 
 
311 aa  79  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  28.16 
 
 
242 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  25.68 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  29.93 
 
 
264 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  27.6 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  27.31 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  31.35 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4163  silent information regulator protein Sir2  26.41 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.146558 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  29.17 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  25.66 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  31.52 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  25.49 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  26.61 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  31.91 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  29.38 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3344  silent information regulator protein Sir2  27.37 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.460999  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  26.98 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>