More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0338 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  67.7 
 
 		 273 aa  347  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  54.73 
 
 		 274 aa  281  5.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  61.9 
 
 		 289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  54.14 
 
 		 272 aa  271  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  54.37 
 
 		 282 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  54.83 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  55.43 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  61.57 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  54.32 
 
 		 278 aa  255  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  56.2 
 
 		 279 aa  254  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  55.16 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  54.69 
 
 		 290 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  55.6 
 
 		 274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  55.29 
 
 		 288 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  54.47 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  55.29 
 
 		 273 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  55.29 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  55.29 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  54.81 
 
 		 271 aa  249  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  47.57 
 
 		 283 aa  248  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  53.26 
 
 		 343 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  56.3 
 
 		 285 aa  248  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 450 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 416 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 416 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 416 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  54.58 
 
 		 290 aa  245  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 343 aa  245  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  52.49 
 
 		 416 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  51.39 
 
 		 280 aa  241  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  52.74 
 
 		 269 aa  234  8e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 255 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  42.86 
 
 		 275 aa  222  4e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  42.37 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  41.15 
 
 		 350 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  27.38 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  29.92 
 
 		 246 aa  96.3  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  35.06 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  29.51 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  34.29 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  36.36 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  29.57 
 
 		 287 aa  89.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  32.77 
 
 		 263 aa  89  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  26.69 
 
 		 242 aa  88.6  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  31.18 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.72 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  34.36 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  32.07 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  30.53 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  34.5 
 
 		 244 aa  85.1  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  34.55 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  29.69 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  30.31 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  30.18 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  30.11 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  29.55 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  29.54 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  30.36 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  35.88 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  30.04 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  31.68 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  30.16 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  30.16 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  34.54 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  28.69 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  29.33 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  29.76 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  33.33 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  27.75 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3283  NAD-dependent deacetylase  31.72 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  28.69 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  27.23 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  26.32 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  32.46 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  31.95 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  30.89 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  28.96 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1453  NAD-dependent deacetylase  27.06 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0321606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  28 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  27.93 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  31.03 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  29.46 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  31.21 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  31.94 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  31.32 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3799  NAD-dependent deacetylase  30.11 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.577483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  31.21 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  29.31 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  25.56 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  26.4 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  29.7 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  31.43 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  30.39 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  29.14 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>