More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2808 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 280 aa  580  1.0000000000000001e-165  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  92.34 
 
 		 277 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  67.52 
 
 		 279 aa  395  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 275 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  66.06 
 
 		 274 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  63.94 
 
 		 278 aa  362  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  65.1 
 
 		 289 aa  352  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  61.71 
 
 		 272 aa  349  3e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  55.51 
 
 		 273 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  51.31 
 
 		 274 aa  278  5e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  47.1 
 
 		 283 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  52.33 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  47.04 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  54.55 
 
 		 271 aa  262  6e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  54.83 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  54.22 
 
 		 285 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  52.43 
 
 		 276 aa  255  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  53.6 
 
 		 269 aa  251  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  49.63 
 
 		 343 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 343 aa  248  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 351 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 416 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  44.03 
 
 		 275 aa  248  8e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 416 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 416 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 450 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  49.82 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  50.18 
 
 		 273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  48.92 
 
 		 273 aa  244  9e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  48.9 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  50.74 
 
 		 282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  51.17 
 
 		 290 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  49.26 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  49.26 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  49.26 
 
 		 289 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  50.6 
 
 		 255 aa  232  6e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  50.79 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  38.91 
 
 		 350 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  29.63 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  36 
 
 		 244 aa  99.4  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  28.51 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  28.73 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  28.4 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  29.15 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  30.85 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  28.29 
 
 		 263 aa  89.7  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  28 
 
 		 249 aa  89.4  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  33.15 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  28.88 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  29.79 
 
 		 249 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  25 
 
 		 311 aa  87  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  31.64 
 
 		 248 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  27.85 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  29.92 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  30.94 
 
 		 269 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1359  silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1401  Silent information regulator protein Sir2  34.08 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0218049 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  29.41 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  30.68 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  30.11 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  24.34 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  29.95 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  31.25 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  30.65 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  29.94 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  30.13 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  27.86 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  24.6 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  29.32 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  27.8 
 
 		 245 aa  80.9  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  28.42 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  26.94 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  29.78 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  26.6 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  31.33 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  30.98 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  30.81 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  31.33 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  30.77 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  28.46 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  26.53 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  26.52 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  28.68 
 
 		 612 aa  77  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  33.33 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  29.07 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  28.21 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  30.27 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  29.21 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  29.12 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  30.41 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  26.67 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  32.18 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  32.2 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  25 
 
 		 242 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  28.73 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  26.63 
 
 		 256 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  33.33 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  27.4 
 
 		 265 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  28.73 
 
 		 260 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  30.11 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>