More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1312 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 274 aa  568  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  58.7 
 
 		 283 aa  330  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  54.21 
 
 		 280 aa  306  3e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  55.84 
 
 		 272 aa  302  4.0000000000000003e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  55.06 
 
 		 273 aa  302  4.0000000000000003e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  50.74 
 
 		 272 aa  286  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  50.92 
 
 		 273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  51.92 
 
 		 276 aa  281  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  54.73 
 
 		 256 aa  281  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  50.94 
 
 		 277 aa  280  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  51.31 
 
 		 280 aa  278  5e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  50 
 
 		 285 aa  276  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  52.42 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  49.08 
 
 		 278 aa  275  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  49.44 
 
 		 297 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  52.02 
 
 		 269 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 416 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  47.79 
 
 		 343 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 450 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 416 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 416 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 351 aa  273  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  48.52 
 
 		 273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  45.59 
 
 		 279 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  51.59 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  48.9 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 343 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  47.43 
 
 		 416 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 275 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  50.58 
 
 		 289 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  47.04 
 
 		 288 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  47.41 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  47.41 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  52.46 
 
 		 271 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  48.65 
 
 		 290 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  49.61 
 
 		 290 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  49.8 
 
 		 255 aa  250  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  37.13 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  32.27 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  27.78 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  34.08 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  31.03 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  32.5 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  27.47 
 
 		 245 aa  102  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  35.14 
 
 		 247 aa  102  7e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  25.43 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  30.66 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  28.22 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  31.91 
 
 		 245 aa  96.3  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  30.3 
 
 		 246 aa  95.1  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  31.46 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  30.91 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  27.16 
 
 		 248 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  29.14 
 
 		 270 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  33.94 
 
 		 245 aa  92  9e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  28.51 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  28.33 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  29.51 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  29.51 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  27.86 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  28.3 
 
 		 289 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  27.73 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  26.45 
 
 		 295 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  31.43 
 
 		 269 aa  89.7  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  29.26 
 
 		 245 aa  89.7  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  29.41 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  30.88 
 
 		 320 aa  89  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  30.17 
 
 		 244 aa  89.4  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2081  Silent information regulator protein Sir2  28.65 
 
 		 259 aa  89  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0787745  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  29.47 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  27.87 
 
 		 583 aa  89  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  23.94 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  29.41 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  26.49 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  29.83 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  30.23 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  26.62 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  25.63 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  30.34 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  23.89 
 
 		 279 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  27.48 
 
 		 311 aa  85.5  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  23.89 
 
 		 279 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  26.29 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  29.48 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  29.63 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 		 612 aa  83.2  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  30.6 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  27.24 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  27.82 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  30.9 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  27.02 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  29.27 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  29.05 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  27.96 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1664  Silent information regulator protein Sir2  28.64 
 
 		 256 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  29.19 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  28.65 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  29.2 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  29.55 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7099  Silent information regulator protein Sir2  28.82 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190475  normal  0.251741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>