57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1313 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  100 
 
 		 287 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  44.57 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  44.84 
 
 		 274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  35.76 
 
 		 612 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62714  conserved hypothetical protein  33.89 
 
 		 583 aa  162  8.000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.424323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  32.72 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  29.43 
 
 		 287 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0675  hypothetical protein  28.77 
 
 		 285 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  32.5 
 
 		 274 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21050  hypothetical protein  26.67 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00950  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  27.37 
 
 		 321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0748135  normal  0.482885 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  30.07 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  30.07 
 
 		 289 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  28.11 
 
 		 275 aa  106  5e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  29.72 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  30 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  30.51 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  31.54 
 
 		 269 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  27.72 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  28.63 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  28.74 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  28.84 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  30 
 
 		 290 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  29.17 
 
 		 278 aa  99  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  28.03 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1057  hypothetical protein  25.83 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  30.49 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  31.33 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 343 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  29.28 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  29.83 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  27.59 
 
 		 273 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0375  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase-like protein  22.63 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0385  hypothetical protein  22.63 
 
 		 314 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  27.53 
 
 		 343 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 450 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 416 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 416 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 416 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 255 aa  89  9e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  25.77 
 
 		 279 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  28.19 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  28.39 
 
 		 416 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  27.56 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  28.84 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  26.77 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  28.4 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  27.2 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  28.16 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00960  hypothetical protein  24.35 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0293493  normal  0.617405 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0448  hypothetical protein  22.64 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0392926  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1648  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  20.63 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  23.92 
 
 		 295 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  25.73 
 
 		 236 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  25 
 
 		 249 aa  42.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>