More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2799 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  57.99 
 
 		 273 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  58.96 
 
 		 343 aa  318  5e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 450 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 351 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 416 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 416 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 416 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  57.84 
 
 		 416 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  59.16 
 
 		 297 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  56.04 
 
 		 289 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  56.93 
 
 		 273 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  56.04 
 
 		 289 aa  305  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  56.18 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  57.54 
 
 		 290 aa  298  5e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  58.7 
 
 		 290 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  55.85 
 
 		 276 aa  295  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  56.91 
 
 		 269 aa  295  8e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  54.78 
 
 		 285 aa  286  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  57.49 
 
 		 271 aa  286  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  54.88 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  53.85 
 
 		 273 aa  272  4.0000000000000004e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  51.59 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  54.83 
 
 		 289 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  51.47 
 
 		 278 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  54.37 
 
 		 256 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  52.42 
 
 		 272 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  50.73 
 
 		 275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  51.79 
 
 		 279 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  49.64 
 
 		 274 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  50.74 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  46.77 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  45.29 
 
 		 272 aa  238  8e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  50.37 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  50.18 
 
 		 280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  43.61 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  41.94 
 
 		 350 aa  221  7e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  31.23 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  31.73 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  29.06 
 
 		 295 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  31.47 
 
 		 269 aa  98.2  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  31.02 
 
 		 251 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  31.06 
 
 		 251 aa  95.5  9e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  29.07 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  29 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  27.72 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  29.1 
 
 		 244 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  25.74 
 
 		 245 aa  85.9  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  29.18 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  29.92 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  30.77 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  30.86 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  34.41 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0653  hypothetical protein  26.06 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  26.69 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  27.17 
 
 		 249 aa  84  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  27.2 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 		 612 aa  83.2  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  27.34 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  27.97 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  28.57 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  29.44 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  29.12 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  26.82 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  32.07 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  30.98 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1872  NAD-dependent deacetylase  25.28 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.747627  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01782  SIR2 family histone deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G09210)  32.56 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0364048 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  27.2 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  28.98 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  30.53 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  28.09 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  26.77 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  32.77 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  25.97 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  28.12 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  28.45 
 
 		 242 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  29.46 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  29.04 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  28.08 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  27.27 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  27.45 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35457  transcriptional regulatory protein  31.69 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0738163  normal  0.450522 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  26.55 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  29.06 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0012  NAD-dependent deacetylase  22.64 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0430  NAD-dependent deacetylase  24.8 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0445  NAD-dependent deacetylase  24.8 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  27.53 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  25.73 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  28.98 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  24.73 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  31.55 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  26.64 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  27.53 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  33.61 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>