More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0024 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0024  Sir2 family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  529  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00361903 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2452  silent information regulator protein Sir2  61.79 
 
 		 290 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4046  Sir2 family NAD-dependent protein deacetylase  61.79 
 
 		 290 aa  307  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0906  silent information regulator protein Sir2  61.13 
 
 		 288 aa  307  9e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.737005 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0465  silent information regulator protein Sir2  61.54 
 
 		 289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0944  silent information regulator protein Sir2  61.54 
 
 		 289 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0813  silent information regulator protein Sir2  61.13 
 
 		 297 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0803  silent information regulator protein Sir2  60.32 
 
 		 273 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2765  silent information regulator protein Sir2  59.13 
 
 		 285 aa  299  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1518  Sir2 family transcriptional regulator  59.35 
 
 		 343 aa  297  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000624517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3035  NAD-dependent deacetylase  58.94 
 
 		 343 aa  295  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2165  Sir2 family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 450 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2035  Sir2 family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 416 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0745  Sir2 family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 416 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2578  Sir2 family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 416 aa  295  6e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3116  Sir2 family transcriptional regulator  58.94 
 
 		 351 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4831  silent information regulator protein Sir2  61.71 
 
 		 269 aa  292  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3089  NAD-dependent deacetylase  58.13 
 
 		 416 aa  290  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2049  Silent information regulator protein Sir2  57.14 
 
 		 276 aa  285  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.044542  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5523  silent information regulator protein Sir2  55.02 
 
 		 273 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0448394  normal  0.0436843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2799  silent information regulator protein Sir2  54.88 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1312  Silent information regulator protein Sir2  49.8 
 
 		 274 aa  250  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4302  silent information regulator protein Sir2  50.79 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.421117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35400  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  52.38 
 
 		 273 aa  248  7e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0919  Silent information regulator protein Sir2  48.05 
 
 		 283 aa  247  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2043  silent information regulator protein Sir2  50.59 
 
 		 272 aa  247  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000115379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2770  Silent information regulator protein Sir2  52.61 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0006  silent information regulator protein Sir2  55.11 
 
 		 271 aa  244  6.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.030337 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3087  Sir2 family transcriptional regulator  51.82 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0397  silent information regulator protein Sir2  50.59 
 
 		 279 aa  241  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0913  silent information regulator protein Sir2  49.2 
 
 		 274 aa  234  8e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3520  silent information regulator protein Sir2  49 
 
 		 280 aa  234  9e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1402  Silent information regulator protein Sir2  49.8 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000472225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0338  Silent information regulator protein Sir2  51.44 
 
 		 256 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2808  Silent information regulator protein Sir2  50.6 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0484605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0817  silent information regulator protein Sir2  47.76 
 
 		 350 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0890  NAD-dependent protein deacetylase (SIR2 family), putative  43.41 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0094897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0825  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuA  45.97 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1313  phosphatase  29.86 
 
 		 287 aa  89  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5036  Silent information regulator protein Sir2  26.47 
 
 		 295 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  27.71 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  33.74 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  31.18 
 
 		 249 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1585  NAD-dependent deacetylase  25.56 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  27.6 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1096  NAD-dependent deacetylase  28.12 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  30.86 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  27.23 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  27.71 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2432  hypothetical protein  28.97 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  27.76 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  26.34 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  26.21 
 
 		 266 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1336  Sir2 family regulator  28.18 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.690541  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  32.53 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  28.4 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  29.26 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  30.91 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  29.01 
 
 		 242 aa  72  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  26.46 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11190  conserved hypothetical protein  27 
 
 		 612 aa  70.9  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.650799  normal  0.436192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2201  hypothetical protein  27.31 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.446593  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  30.12 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  25.97 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  31.1 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  28.66 
 
 		 263 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  32.32 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  30.25 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  31.82 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0397  silent information regulator protein Sir2  29.52 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.470368  hitchhiker  0.0010644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  29.94 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  26.32 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  28.91 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  26.07 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0671  hypothetical protein  25.35 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.40153e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  27.44 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  28.05 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  26.64 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  26.83 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2230  NAD-dependent deacetylase  26.27 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  28.92 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  27.23 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  27.63 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  26.64 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  26.41 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  26.79 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  26.06 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  25.56 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  27.44 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3645  NAD-dependent deacetylase  28.24 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.755561  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3073  Silent information regulator protein Sir2  30.38 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.224532  decreased coverage  0.0000000244595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  24.66 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  26.79 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0249  NAD-dependent deacetylase  28.4 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.390729  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  28 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1781  Silent information regulator protein Sir2  27.93 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.266832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  30.59 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  27.27 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  26.01 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  26.67 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>